290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2310 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  100 
 
 
488 aa  1010    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  99.8 
 
 
488 aa  1008    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  99.8 
 
 
488 aa  1007    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  99.8 
 
 
488 aa  1008    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  96.93 
 
 
488 aa  981    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  98.16 
 
 
488 aa  990    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  99.8 
 
 
488 aa  1008    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  99.14 
 
 
358 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.66 
 
 
497 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.98 
 
 
490 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
488 aa  1010    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  63.98 
 
 
490 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  81.35 
 
 
488 aa  836    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.58 
 
 
493 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  62.32 
 
 
495 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  62.53 
 
 
495 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  60.88 
 
 
498 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  56.61 
 
 
487 aa  570  1e-161  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  57.85 
 
 
487 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.53 
 
 
488 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  56.08 
 
 
486 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  55.88 
 
 
486 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.08 
 
 
486 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  56.08 
 
 
486 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  56.9 
 
 
488 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  57.11 
 
 
488 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  56.08 
 
 
486 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  55.88 
 
 
486 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  55.17 
 
 
486 aa  555  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  56.08 
 
 
486 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  56.68 
 
 
488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  56.68 
 
 
488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  54.96 
 
 
486 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  56.2 
 
 
488 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  55.88 
 
 
486 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  54.96 
 
 
486 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.67 
 
 
488 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  54.96 
 
 
490 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.96 
 
 
486 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  54.74 
 
 
486 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  54.74 
 
 
486 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  54.74 
 
 
486 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  54.53 
 
 
486 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.31 
 
 
490 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.53 
 
 
486 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  57.02 
 
 
490 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  57.02 
 
 
490 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  57.23 
 
 
490 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  57.23 
 
 
490 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  61.76 
 
 
452 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  56.81 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.56 
 
 
490 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  49.79 
 
 
490 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  49.79 
 
 
490 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  49.58 
 
 
490 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.94 
 
 
493 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  49.79 
 
 
490 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  48.22 
 
 
492 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  48.12 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.37 
 
 
486 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  47.12 
 
 
489 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.49 
 
 
497 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  47.17 
 
 
485 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.02 
 
 
493 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.44 
 
 
496 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  47.7 
 
 
464 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  47.48 
 
 
455 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.39 
 
 
497 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.7 
 
 
459 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.17 
 
 
494 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  42.65 
 
 
491 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  44.69 
 
 
490 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  41.81 
 
 
497 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.92 
 
 
491 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.82 
 
 
505 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  43.83 
 
 
484 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.19 
 
 
492 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  45.77 
 
 
510 aa  364  2e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  43.74 
 
 
485 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.16 
 
 
491 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  44.51 
 
 
478 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  41.67 
 
 
491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.49 
 
 
492 aa  355  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.74 
 
 
505 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 
483 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.14 
 
 
497 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.83 
 
 
506 aa  349  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  40.33 
 
 
499 aa  348  9e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.04 
 
 
490 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.38 
 
 
493 aa  348  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  42.47 
 
 
520 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.42 
 
 
491 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  39.96 
 
 
493 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  40.83 
 
 
497 aa  341  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  42.07 
 
 
471 aa  339  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.41 
 
 
493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.6 
 
 
528 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.55 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  43.17 
 
 
451 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.15 
 
 
487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>