296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5747 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  100 
 
 
492 aa  981    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  48.88 
 
 
497 aa  465  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.48 
 
 
505 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.42 
 
 
486 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  52.22 
 
 
493 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  52.5 
 
 
493 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  44.24 
 
 
492 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  51.59 
 
 
509 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  48.69 
 
 
490 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  48.75 
 
 
496 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.66 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  43.9 
 
 
491 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  50.11 
 
 
464 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  50.11 
 
 
455 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.37 
 
 
490 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  48.58 
 
 
459 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  47.95 
 
 
489 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.85 
 
 
487 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  48.07 
 
 
491 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  45.94 
 
 
487 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.04 
 
 
528 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  45.12 
 
 
486 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.12 
 
 
486 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.92 
 
 
486 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  45.12 
 
 
486 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  43.92 
 
 
486 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.53 
 
 
495 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  43.92 
 
 
486 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  43.92 
 
 
486 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  45.38 
 
 
490 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  45.38 
 
 
490 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  45.38 
 
 
490 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  45.12 
 
 
486 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  43.51 
 
 
486 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  45.51 
 
 
490 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.91 
 
 
488 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  43.51 
 
 
486 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  45.17 
 
 
490 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  46.85 
 
 
488 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  43.51 
 
 
486 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  44.9 
 
 
486 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.92 
 
 
495 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  44.9 
 
 
486 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  44.9 
 
 
486 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  46.85 
 
 
488 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  46.85 
 
 
488 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  45.32 
 
 
488 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  43.4 
 
 
488 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.94 
 
 
490 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  43.03 
 
 
491 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  46.64 
 
 
488 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  44.33 
 
 
498 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  43.19 
 
 
488 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.19 
 
 
488 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.51 
 
 
486 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  47.78 
 
 
489 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  47.99 
 
 
498 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  43.19 
 
 
488 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  43.13 
 
 
488 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.19 
 
 
488 aa  372  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  44.69 
 
 
486 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  47.78 
 
 
489 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  47.78 
 
 
489 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  47.99 
 
 
489 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  43.19 
 
 
488 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  47.99 
 
 
489 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  47.78 
 
 
489 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  43.51 
 
 
486 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  43.19 
 
 
488 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.01 
 
 
490 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  44.01 
 
 
490 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.06 
 
 
493 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  49.77 
 
 
478 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  44 
 
 
497 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42 
 
 
490 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.47 
 
 
460 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.47 
 
 
460 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  40.93 
 
 
490 aa  362  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.98 
 
 
485 aa  363  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.62 
 
 
488 aa  362  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  43.42 
 
 
488 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  44.75 
 
 
497 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.8 
 
 
493 aa  359  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40 
 
 
493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  43.25 
 
 
520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.18 
 
 
505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  41.21 
 
 
491 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.48 
 
 
497 aa  355  7.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  41.06 
 
 
487 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  51.44 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.32 
 
 
499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.27 
 
 
500 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  46.39 
 
 
484 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  41.41 
 
 
491 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.25 
 
 
491 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  44.09 
 
 
485 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  46.43 
 
 
458 aa  345  1e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  43.24 
 
 
473 aa  345  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  43.09 
 
 
503 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.82 
 
 
506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>