290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3970 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  100 
 
 		 473 aa  939    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.16 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.78 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  42.74 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  36.22 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.67 
 
 		 505 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  39.18 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.14 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.24 
 
 		 486 aa  293  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.05 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.05 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.23 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  40.42 
 
 		 490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.82 
 
 		 497 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  38.1 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  34.27 
 
 		 490 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  42.33 
 
 		 455 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  41.84 
 
 		 491 aa  279  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  42.14 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.34 
 
 		 495 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  37.58 
 
 		 486 aa  276  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.81 
 
 		 495 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  37.37 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  37.37 
 
 		 486 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  39.75 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  37.37 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  37.37 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  39.58 
 
 		 488 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  39.37 
 
 		 488 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  39.37 
 
 		 488 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.52 
 
 		 487 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  38.11 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  39.16 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.16 
 
 		 490 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  36.73 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  37.17 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.17 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  37.17 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  39.18 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  36.65 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  39.16 
 
 		 488 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  38.11 
 
 		 486 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  38.32 
 
 		 486 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  40.6 
 
 		 459 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  36.44 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  36.44 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.44 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.44 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  36.44 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.11 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  36.08 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.68 
 
 		 486 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.49 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.25 
 
 		 505 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  37.47 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  38.49 
 
 		 490 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  38.24 
 
 		 489 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  37.68 
 
 		 486 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  36.33 
 
 		 488 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.05 
 
 		 493 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  37.89 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  37.89 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  37.47 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  39.44 
 
 		 498 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  39.44 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  39.44 
 
 		 489 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  34.74 
 
 		 487 aa  263  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  38.49 
 
 		 490 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  38.49 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  38.49 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  38.49 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  38.28 
 
 		 490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  37.27 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  35.76 
 
 		 497 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  41.06 
 
 		 510 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.1 
 
 		 488 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  39.81 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.43 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  36.07 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  35.62 
 
 		 491 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  37.01 
 
 		 491 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.75 
 
 		 472 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.11 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  34.34 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  38.55 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  33.87 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.82 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.79 
 
 		 491 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  33.47 
 
 		 493 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  35.46 
 
 		 472 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  38.99 
 
 		 478 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.46 
 
 		 472 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  37.7 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.58 
 
 		 483 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  36.68 
 
 		 497 aa  246  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  42.62 
 
 		 430 aa  246  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>