293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2037 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  80.86 
 
 
491 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  67.21 
 
 
493 aa  682    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  68.37 
 
 
493 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  71.02 
 
 
490 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
491 aa  1004    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  81.67 
 
 
491 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  73.73 
 
 
491 aa  726    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  63.14 
 
 
491 aa  631  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  51.16 
 
 
497 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  49.69 
 
 
497 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.08 
 
 
494 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  49.19 
 
 
503 aa  440  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  48.25 
 
 
497 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  46.97 
 
 
500 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.61 
 
 
506 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.49 
 
 
492 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.73 
 
 
505 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.56 
 
 
494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  43.56 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  46.68 
 
 
499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.58 
 
 
659 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  44.92 
 
 
472 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.92 
 
 
472 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.01 
 
 
472 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.63 
 
 
528 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  44.67 
 
 
493 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  44.79 
 
 
493 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  49.89 
 
 
486 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  46.36 
 
 
520 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.71 
 
 
505 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.25 
 
 
589 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.97 
 
 
486 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.03 
 
 
494 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  41.31 
 
 
497 aa  385  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  41.91 
 
 
502 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  42.31 
 
 
493 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.11 
 
 
488 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  42.65 
 
 
486 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  42.65 
 
 
486 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.65 
 
 
486 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  42.65 
 
 
486 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  42.65 
 
 
486 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  42.65 
 
 
486 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  42.65 
 
 
486 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  43.19 
 
 
477 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  42.44 
 
 
486 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.19 
 
 
477 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  41.56 
 
 
495 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.15 
 
 
490 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  43.15 
 
 
490 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.37 
 
 
497 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.24 
 
 
493 aa  364  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  43.01 
 
 
498 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.66 
 
 
487 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  42.16 
 
 
488 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.16 
 
 
488 aa  362  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.16 
 
 
488 aa  362  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  42.16 
 
 
488 aa  362  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  42.16 
 
 
488 aa  362  6e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.17 
 
 
509 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  38.4 
 
 
492 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  40.25 
 
 
490 aa  362  8e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  48.46 
 
 
509 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.46 
 
 
509 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  41.51 
 
 
488 aa  362  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  41.51 
 
 
488 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  42.86 
 
 
506 aa  358  9e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.73 
 
 
509 aa  358  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.51 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  41.43 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  41.31 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  41.29 
 
 
489 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  42.5 
 
 
488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  41.09 
 
 
490 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  45.82 
 
 
496 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  41.3 
 
 
490 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  40.88 
 
 
490 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  41 
 
 
490 aa  353  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  40.79 
 
 
490 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.98 
 
 
497 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  41.3 
 
 
492 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.78 
 
 
495 aa  346  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.04 
 
 
493 aa  345  8e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  42.37 
 
 
459 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  40.21 
 
 
487 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  39.7 
 
 
487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  43.39 
 
 
492 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.76 
 
 
490 aa  340  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.87 
 
 
495 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  43.54 
 
 
455 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  39.83 
 
 
488 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  39.83 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  39.83 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  43.21 
 
 
464 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  39.63 
 
 
488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  39.42 
 
 
488 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 
488 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  39.75 
 
 
486 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.29 
 
 
488 aa  334  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  41.24 
 
 
485 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>