289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0779 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  100 
 
 
500 aa  1042    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.19 
 
 
506 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  55.63 
 
 
484 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  46.93 
 
 
497 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.34 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  46.44 
 
 
497 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.61 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  46.23 
 
 
491 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  45.64 
 
 
493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  48.43 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  46.35 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.35 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  45.25 
 
 
503 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  45.51 
 
 
493 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  42.71 
 
 
497 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.97 
 
 
491 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  46.14 
 
 
491 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  42.86 
 
 
472 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.86 
 
 
472 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.06 
 
 
472 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  46.91 
 
 
491 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.67 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.53 
 
 
499 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  43.29 
 
 
502 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  42.68 
 
 
492 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  40.17 
 
 
493 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  40.17 
 
 
493 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.25 
 
 
589 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  40.82 
 
 
520 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.96 
 
 
659 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  40.33 
 
 
492 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.94 
 
 
488 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.12 
 
 
494 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  38.88 
 
 
495 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.87 
 
 
494 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  39.75 
 
 
497 aa  361  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  38.94 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.1 
 
 
477 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  37.15 
 
 
493 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.91 
 
 
505 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  39.54 
 
 
492 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.1 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.92 
 
 
486 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.13 
 
 
493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.75 
 
 
486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  39.75 
 
 
486 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  39.75 
 
 
486 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  38.01 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  39.54 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  39.54 
 
 
486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  39.54 
 
 
486 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  38.96 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  41.32 
 
 
486 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  39.33 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.01 
 
 
487 aa  336  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  39.87 
 
 
496 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  39.33 
 
 
486 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  39.05 
 
 
499 aa  332  8e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  37.73 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  38.78 
 
 
498 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.05 
 
 
497 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  38.65 
 
 
490 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  38.65 
 
 
490 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  38.43 
 
 
490 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 
495 aa  319  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.89 
 
 
509 aa  319  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  38.43 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  38.43 
 
 
490 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  38.1 
 
 
488 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  36.89 
 
 
458 aa  317  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.39 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  37.02 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 
495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  35.46 
 
 
487 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.52 
 
 
490 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  39.52 
 
 
490 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  39.81 
 
 
459 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  37.23 
 
 
488 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  38.36 
 
 
464 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  37.45 
 
 
488 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  39.12 
 
 
455 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  37.39 
 
 
488 aa  309  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  37.01 
 
 
488 aa  309  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.01 
 
 
488 aa  309  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  37.01 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.01 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  37.01 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  36.44 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
498 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
489 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
489 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  38.2 
 
 
489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  37.18 
 
 
488 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  37.18 
 
 
488 aa  306  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  36.12 
 
 
488 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.55 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  36.97 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>