288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1732 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  99.79 
 
 		 477 aa  966    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 477 aa  971    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  89.29 
 
 		 477 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.51 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  57.98 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.09 
 
 		 659 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  57.32 
 
 		 493 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.63 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.5 
 
 		 589 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  55.02 
 
 		 495 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  56 
 
 		 492 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  55.81 
 
 		 499 aa  502  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  55.79 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.14 
 
 		 487 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  46.75 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  48.22 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  44.79 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  45.97 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.37 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.07 
 
 		 505 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  45.19 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  45.21 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.19 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  44.79 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.72 
 
 		 528 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  40.57 
 
 		 484 aa  363  4e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.77 
 
 		 492 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.02 
 
 		 506 aa  359  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  42.86 
 
 		 491 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  42.19 
 
 		 493 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  39.1 
 
 		 500 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  42.56 
 
 		 490 aa  352  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  42.14 
 
 		 493 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  40.12 
 
 		 502 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.98 
 
 		 488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  41.05 
 
 		 499 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  40.3 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.3 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.3 
 
 		 472 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  41.14 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.88 
 
 		 486 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  38.08 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.87 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.55 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  44.15 
 
 		 506 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  38.94 
 
 		 488 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  40.13 
 
 		 489 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  40.27 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  38.72 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  38.72 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  38.72 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.72 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  38.99 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  39.54 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  38.25 
 
 		 486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  43.8 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  38.05 
 
 		 486 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  38.62 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  38.05 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  37.84 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.6 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  37.12 
 
 		 490 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.17 
 
 		 490 aa  297  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  37.79 
 
 		 486 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  36.82 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  37.63 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  37.79 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.73 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.27 
 
 		 495 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  37.79 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  37.63 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  37.63 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  37.79 
 
 		 486 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  36.82 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  36.82 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.42 
 
 		 486 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.63 
 
 		 486 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  37.58 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.58 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.28 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  37.58 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.38 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.27 
 
 		 497 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  41.52 
 
 		 455 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  36.21 
 
 		 487 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  42.42 
 
 		 464 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  37.58 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.72 
 
 		 509 aa  292  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  42.72 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.72 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  37.53 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  37.61 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  37.61 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  37.61 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 		 488 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 		 488 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 		 488 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  37.42 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  37.13 
 
 		 488 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>