288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0426 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  68.17 
 
 
499 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  68.52 
 
 
499 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  100 
 
 
492 aa  1014    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  56 
 
 
477 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56 
 
 
477 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  53.57 
 
 
477 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.92 
 
 
494 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.52 
 
 
659 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.67 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.52 
 
 
487 aa  445  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.28 
 
 
494 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  48.87 
 
 
493 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  49.07 
 
 
493 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  46 
 
 
495 aa  428  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  45.02 
 
 
497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  43.56 
 
 
497 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.57 
 
 
494 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  40.33 
 
 
500 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  42.98 
 
 
491 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.53 
 
 
492 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.06 
 
 
505 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  42.62 
 
 
491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  40.32 
 
 
484 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  38.12 
 
 
502 aa  349  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.37 
 
 
506 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.35 
 
 
491 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  42.21 
 
 
491 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  39.63 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.57 
 
 
488 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  44.06 
 
 
491 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.98 
 
 
486 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  37.63 
 
 
497 aa  333  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.55 
 
 
492 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.57 
 
 
472 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.21 
 
 
486 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.21 
 
 
486 aa  330  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.21 
 
 
486 aa  330  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.21 
 
 
486 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  37.96 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.96 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  40 
 
 
486 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  40.84 
 
 
503 aa  326  5e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40 
 
 
486 aa  326  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40 
 
 
486 aa  326  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.79 
 
 
486 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  40.26 
 
 
493 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.74 
 
 
528 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  37.78 
 
 
499 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  41.86 
 
 
493 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  41.67 
 
 
490 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.55 
 
 
509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  39.75 
 
 
509 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.75 
 
 
509 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  38.84 
 
 
520 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  39.84 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  40.69 
 
 
506 aa  312  9e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  37.81 
 
 
493 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
490 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  38.14 
 
 
489 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  40.04 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.35 
 
 
505 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  36.12 
 
 
488 aa  303  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  37.4 
 
 
486 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.87 
 
 
493 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  37.4 
 
 
486 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  38.14 
 
 
488 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  38.14 
 
 
488 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  38.14 
 
 
488 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  39.78 
 
 
459 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  35.25 
 
 
487 aa  299  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  39.73 
 
 
486 aa  299  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  37.4 
 
 
486 aa  299  7e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  37.2 
 
 
486 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.4 
 
 
486 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  37.73 
 
 
488 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  40.23 
 
 
498 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  37.73 
 
 
488 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  36.99 
 
 
486 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  37.37 
 
 
486 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  37.37 
 
 
486 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.79 
 
 
486 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  36.59 
 
 
492 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  36.54 
 
 
488 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  36.11 
 
 
488 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  39.43 
 
 
496 aa  291  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  35.64 
 
 
488 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  41.4 
 
 
455 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  41.15 
 
 
464 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  35.89 
 
 
488 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.89 
 
 
488 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  35.89 
 
 
488 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  35.89 
 
 
488 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.89 
 
 
488 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.53 
 
 
490 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.94 
 
 
493 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  39.78 
 
 
490 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  39.78 
 
 
490 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>