285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4259 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  100 
 
 
482 aa  986    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  43.76 
 
 
488 aa  435  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  44.83 
 
 
483 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.24 
 
 
469 aa  434  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  44.63 
 
 
483 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  42.94 
 
 
488 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  43.48 
 
 
483 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  43.84 
 
 
483 aa  428  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  43.6 
 
 
483 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  43.49 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  43.19 
 
 
481 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  43.01 
 
 
485 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  41.67 
 
 
481 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.14 
 
 
514 aa  313  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  34.54 
 
 
478 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.13 
 
 
525 aa  279  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.72 
 
 
513 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  33.48 
 
 
496 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  33.75 
 
 
507 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  32.02 
 
 
505 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  32.7 
 
 
501 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  32.84 
 
 
481 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  30.73 
 
 
378 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.27 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.63 
 
 
488 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  25.56 
 
 
496 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.52 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.93 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  27.93 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.93 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  24.05 
 
 
491 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.92 
 
 
386 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.92 
 
 
386 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  26.65 
 
 
482 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  27.86 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  26.32 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  26.15 
 
 
455 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  24.58 
 
 
510 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  25.91 
 
 
464 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  22.89 
 
 
473 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.82 
 
 
382 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.03 
 
 
378 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.61 
 
 
486 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.41 
 
 
487 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  27.02 
 
 
423 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  27.69 
 
 
386 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.89 
 
 
493 aa  123  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  24.79 
 
 
490 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  24.53 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.13 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.62 
 
 
495 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  25.98 
 
 
486 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  22.8 
 
 
490 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  22.8 
 
 
490 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  25.98 
 
 
486 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.66 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.74 
 
 
486 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  24.58 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  24.84 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.33 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  24.43 
 
 
490 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.15 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  25.49 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  26.5 
 
 
430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  25.49 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  25.49 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  25.49 
 
 
486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  25.49 
 
 
486 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  24.58 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  24.69 
 
 
502 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.65 
 
 
499 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  28.16 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  23.48 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  23.64 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  24.31 
 
 
488 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.1 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.57 
 
 
505 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.1 
 
 
488 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.58 
 
 
488 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4796  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.06 
 
 
462 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.58 
 
 
488 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.58 
 
 
488 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.58 
 
 
488 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.58 
 
 
488 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  22.48 
 
 
452 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  22.64 
 
 
451 aa  113  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.49 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>