289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5059 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 475 aa  923    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2129  Mannitol dehydrogenase domain  50.94 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.72 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  47.51 
 
 		 510 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  42.63 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.38 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  36.94 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  42.04 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.81 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  42.28 
 
 		 486 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  42.28 
 
 		 486 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  45.18 
 
 		 490 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.28 
 
 		 486 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  42.48 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  42.24 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  46 
 
 		 493 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  42.04 
 
 		 486 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  42.04 
 
 		 486 aa  279  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  39.96 
 
 		 492 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  44.39 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.96 
 
 		 486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  38.96 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  38.96 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.28 
 
 		 486 aa  273  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  38.53 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  38.53 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  38.53 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  38.53 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  36.84 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  41.84 
 
 		 487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  42.55 
 
 		 488 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  42.31 
 
 		 488 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.05 
 
 		 501 aa  269  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  42.31 
 
 		 488 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  42.14 
 
 		 488 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  42.31 
 
 		 488 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.53 
 
 		 490 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  42.27 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  42.27 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  42.27 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  38.31 
 
 		 486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  42.05 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  42.05 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  42.05 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  42.05 
 
 		 489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  38.1 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  38.1 
 
 		 490 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  38.1 
 
 		 490 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  38.1 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  35.06 
 
 		 487 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.24 
 
 		 490 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 490 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  37.88 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  42.42 
 
 		 430 aa  262  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  37.5 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  37.72 
 
 		 488 aa  262  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.84 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.84 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  37.28 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  36.85 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.85 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  36.85 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.85 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  36.85 
 
 		 488 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4288  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.24 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.760127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.12 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  38.01 
 
 		 488 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  40.24 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.49 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  40.23 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  43.5 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  41.81 
 
 		 496 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.81 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.21 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.11 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.11 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  40.58 
 
 		 482 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.15 
 
 		 490 aa  253  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  36.75 
 
 		 490 aa  252  9.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  39.51 
 
 		 485 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.81 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.73 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  38.9 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.86 
 
 		 483 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  40.57 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.45 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  40.99 
 
 		 485 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  39.67 
 
 		 499 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.28 
 
 		 509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.79 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.3 
 
 		 528 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  42.32 
 
 		 503 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.75 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.49 
 
 		 486 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  39.71 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  40.05 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.63 
 
 		 485 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  35.32 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>