287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4288 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4288  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 
499 aa  992    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.760127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.87 
 
 
493 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.59 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.8 
 
 
486 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  37.87 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.04 
 
 
484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  42.86 
 
 
510 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.78 
 
 
497 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  40.83 
 
 
497 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.36 
 
 
493 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  40.3 
 
 
492 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  40.41 
 
 
490 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.81 
 
 
493 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  44.9 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  36.86 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.86 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  36.86 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  40.17 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  41.59 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  36.86 
 
 
486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  36.46 
 
 
486 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  36.65 
 
 
486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  34.86 
 
 
487 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  36.65 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  36.65 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  36.44 
 
 
488 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.42 
 
 
486 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  36.34 
 
 
490 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
486 aa  280  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  38.41 
 
 
488 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
486 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  39.55 
 
 
484 aa  279  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  38.41 
 
 
488 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  36.6 
 
 
488 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  38.41 
 
 
488 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  43.65 
 
 
464 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  38.21 
 
 
488 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  36.13 
 
 
490 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  36.02 
 
 
488 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  37.22 
 
 
486 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  43.85 
 
 
455 aa  277  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  36.13 
 
 
490 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.07 
 
 
499 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  36.13 
 
 
490 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  37.01 
 
 
486 aa  276  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  37.01 
 
 
486 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.22 
 
 
486 aa  276  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  37.01 
 
 
486 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  36.13 
 
 
490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  35.81 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  35.81 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.81 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  40.42 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  38.21 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  41.03 
 
 
478 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  35.81 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.81 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  37.01 
 
 
486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  36.75 
 
 
487 aa  273  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  42.48 
 
 
493 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  42.73 
 
 
548 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.44 
 
 
488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.52 
 
 
501 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.45 
 
 
505 aa  269  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  40.14 
 
 
489 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  37.12 
 
 
488 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  37.05 
 
 
498 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.87 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
489 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
489 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  44.96 
 
 
489 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.13 
 
 
488 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  36.84 
 
 
490 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  39.35 
 
 
485 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.96 
 
 
509 aa  265  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.84 
 
 
490 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.04 
 
 
490 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2129  Mannitol dehydrogenase domain  42.08 
 
 
482 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.61 
 
 
488 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.32 
 
 
487 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  34.83 
 
 
490 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.95 
 
 
495 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.39 
 
 
497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  37.17 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  39.87 
 
 
491 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.45 
 
 
495 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  40.15 
 
 
486 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  42.49 
 
 
475 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  37.96 
 
 
491 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  37.11 
 
 
497 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  34.13 
 
 
500 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  37.79 
 
 
493 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  37.53 
 
 
493 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.46 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.98 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.31 
 
 
494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>