289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2129 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2129  Mannitol dehydrogenase domain  100 
 
 		 482 aa  940    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  51.36 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.03 
 
 		 493 aa  293  6e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.02 
 
 		 493 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  36.59 
 
 		 492 aa  279  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  45.15 
 
 		 510 aa  279  9e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  40.46 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  45.65 
 
 		 498 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  45.65 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  43.66 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  45.65 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  45.41 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  45.41 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  45.41 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  45.41 
 
 		 489 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4288  Mannitol dehydrogenase domain protein  42 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.760127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.9 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.2 
 
 		 487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  39.5 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.68 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.68 
 
 		 460 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  40.09 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  40.09 
 
 		 488 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  40.41 
 
 		 496 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  40.09 
 
 		 488 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.74 
 
 		 495 aa  259  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  39.64 
 
 		 488 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  39.73 
 
 		 488 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.31 
 
 		 470 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.56 
 
 		 497 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.58 
 
 		 495 aa  256  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  37.19 
 
 		 486 aa  256  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.15 
 
 		 486 aa  256  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.28 
 
 		 484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  41 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  37.08 
 
 		 486 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  39.11 
 
 		 486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  37.35 
 
 		 490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  37.19 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  37.19 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  37.08 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.08 
 
 		 486 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.97 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.59 
 
 		 486 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  37.08 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  36.59 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  36.59 
 
 		 486 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  36.38 
 
 		 486 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  36.59 
 
 		 486 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.72 
 
 		 505 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  36.38 
 
 		 486 aa  251  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  35.99 
 
 		 488 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  36.38 
 
 		 486 aa  249  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  42.56 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  36.38 
 
 		 486 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.78 
 
 		 488 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  35.78 
 
 		 488 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  35.78 
 
 		 488 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.78 
 
 		 488 aa  246  8e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  35.78 
 
 		 488 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  35.99 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  39.45 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  36.07 
 
 		 490 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  36.07 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  35.78 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.86 
 
 		 488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  36.07 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  36.04 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  35.85 
 
 		 490 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  38.03 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  36.04 
 
 		 490 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  36.04 
 
 		 490 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  36.04 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.83 
 
 		 497 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  40.32 
 
 		 493 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  35.85 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.79 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  38.45 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3014  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.78 
 
 		 501 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.264666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.88 
 
 		 490 aa  240  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.85 
 
 		 490 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  36.85 
 
 		 490 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  34.27 
 
 		 487 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  38.28 
 
 		 484 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  38.76 
 
 		 492 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  41.53 
 
 		 548 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  39.51 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.46 
 
 		 490 aa  236  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.01 
 
 		 488 aa  236  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1886  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.49 
 
 		 485 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.884338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  37.44 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.17 
 
 		 493 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  36.85 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.41 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  38.3 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  39.22 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  39.45 
 
 		 499 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  34.16 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  36.6 
 
 		 520 aa  223  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>