275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5504 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 481 aa  996    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.81 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  54.24 
 
 		 496 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  49.27 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  46.68 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.53 
 
 		 513 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  46.32 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  35.85 
 
 		 478 aa  272  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  33.95 
 
 		 485 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  34.03 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  33.82 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  33.68 
 
 		 488 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.98 
 
 		 469 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  34.51 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  33.26 
 
 		 488 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  34.5 
 
 		 483 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  34.5 
 
 		 483 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  34.5 
 
 		 483 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  34.5 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.5 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  34.5 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  34.5 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  32.84 
 
 		 482 aa  260  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  34.5 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  34.38 
 
 		 483 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  33.06 
 
 		 483 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  34.03 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  34.24 
 
 		 481 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.2 
 
 		 514 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.93 
 
 		 378 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 		 383 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  32.45 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.45 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 		 387 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.48 
 
 		 373 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.43 
 
 		 382 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  30.16 
 
 		 386 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  29.26 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.2 
 
 		 495 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.63 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.97 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  27.75 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.5 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.9 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.22 
 
 		 495 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  27.29 
 
 		 496 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.31 
 
 		 488 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  25.52 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.91 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.42 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.41 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.37 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  27.19 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  26.64 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.64 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.57 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.3 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.3 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  26.42 
 
 		 430 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.46 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  26.37 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.35 
 
 		 366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  28.03 
 
 		 510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.76 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  29.35 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.78 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  25.62 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  24.12 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  26.38 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.82 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  27.54 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  27.75 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  25.93 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  25.29 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  25 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.51 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.51 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.51 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.51 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  24.51 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.51 
 
 		 488 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.61 
 
 		 497 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  28.93 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  23.63 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  24.05 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  24.05 
 
 		 488 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  24.05 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  25.32 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  23.8 
 
 		 488 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.51 
 
 		 487 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  22.94 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.41 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  24.27 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.7 
 
 		 505 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>