278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1734 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  100 
 
 
378 aa  767    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.65 
 
 
386 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.37 
 
 
386 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  44.73 
 
 
386 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.92 
 
 
383 aa  275  7e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.32 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.01 
 
 
373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.5 
 
 
387 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  41.21 
 
 
387 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.21 
 
 
387 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  42.13 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.57 
 
 
366 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  30.45 
 
 
485 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  30.73 
 
 
482 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  31.17 
 
 
478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.88 
 
 
513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.85 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.64 
 
 
469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  28.8 
 
 
481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  29.43 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  27.89 
 
 
507 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  31.12 
 
 
483 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  29.05 
 
 
501 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  30.61 
 
 
483 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.31 
 
 
514 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  26.18 
 
 
505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  30.45 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  28.95 
 
 
483 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  30.61 
 
 
483 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  31.2 
 
 
488 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  30.41 
 
 
483 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  30.41 
 
 
483 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  30.41 
 
 
481 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  30.41 
 
 
483 aa  112  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  30.26 
 
 
481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  30.41 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.41 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  30.41 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  30.41 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  30.41 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.45 
 
 
460 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.45 
 
 
460 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  30.03 
 
 
488 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  27.85 
 
 
497 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  30.97 
 
 
485 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.21 
 
 
488 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.81 
 
 
499 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  32.34 
 
 
498 aa  99.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  27.25 
 
 
493 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  29.01 
 
 
492 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  31.28 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.17 
 
 
493 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  26.46 
 
 
491 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.3 
 
 
492 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  30.6 
 
 
473 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  28.75 
 
 
493 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  31.58 
 
 
490 aa  92.8  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.87 
 
 
506 aa  92.8  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.58 
 
 
490 aa  92.8  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  31.58 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.71 
 
 
659 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  32.01 
 
 
548 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  27.03 
 
 
520 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  30.71 
 
 
490 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  26.98 
 
 
503 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  25.92 
 
 
500 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  33.21 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  30.31 
 
 
451 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.46 
 
 
505 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  27.44 
 
 
472 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.44 
 
 
472 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  26.33 
 
 
493 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  25.32 
 
 
495 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  31.2 
 
 
430 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.06 
 
 
487 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  26.53 
 
 
491 aa  89.4  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  25.93 
 
 
491 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.74 
 
 
495 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  25.75 
 
 
464 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.37 
 
 
470 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  26.37 
 
 
490 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.74 
 
 
495 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.81 
 
 
497 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  28.51 
 
 
492 aa  87.4  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.64 
 
 
468 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.8 
 
 
589 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  26.92 
 
 
497 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.82 
 
 
488 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.47 
 
 
472 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  29.36 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  29.36 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  28.92 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  28.92 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.92 
 
 
488 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  28.57 
 
 
459 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  26.44 
 
 
491 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2406  mannitol dehydrogenase domain protein  29.37 
 
 
482 aa  86.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0249546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  29.36 
 
 
488 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>