281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6833 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 501 aa  1035    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  47.72 
 
 		 513 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  47.08 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  44.83 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  46.32 
 
 		 481 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.16 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  43.46 
 
 		 507 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  36.17 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  36.38 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  35.17 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  35.97 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  35.97 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  36.17 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  36.17 
 
 		 483 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  36.5 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  35.79 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.46 
 
 		 469 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  35.37 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  34.74 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  32.7 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  34.03 
 
 		 478 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.86 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.51 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  28.51 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.48 
 
 		 378 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.5 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  29.53 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.53 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  29.53 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  29.53 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.53 
 
 		 488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.65 
 
 		 373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  30.42 
 
 		 488 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  30.42 
 
 		 488 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  27.89 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  30.27 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.27 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  29.79 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.79 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  27.52 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.73 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  28.14 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.65 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  29.09 
 
 		 455 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  29.09 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.93 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  25.66 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  29.05 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.81 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.35 
 
 		 488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.14 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.14 
 
 		 386 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  26.43 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  25.05 
 
 		 486 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.16 
 
 		 495 aa  120  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  25.63 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  25.63 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.88 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  31.45 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.63 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  26.26 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  30.75 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.39 
 
 		 490 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  24.85 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.85 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  24.64 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  26.85 
 
 		 488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  26.85 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  26.85 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  26.39 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  26.39 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  27.05 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  27.09 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  26.5 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.05 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.25 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  26.04 
 
 		 496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  26.92 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  26.92 
 
 		 486 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  29.56 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  26.92 
 
 		 486 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  26.92 
 
 		 486 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.66 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.8 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  26.4 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.19 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  26.7 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  30.75 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  25.29 
 
 		 548 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  31.5 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.42 
 
 		 486 aa  107  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.7 
 
 		 486 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  25.4 
 
 		 489 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>