261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6468 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  100 
 
 
387 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  95.09 
 
 
387 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.18 
 
 
378 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.45 
 
 
386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  68.98 
 
 
386 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  67.91 
 
 
386 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.45 
 
 
373 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.32 
 
 
382 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.4 
 
 
383 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  41.21 
 
 
378 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 
366 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  44.44 
 
 
366 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  30.21 
 
 
485 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  32.01 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  31 
 
 
525 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  30.29 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  31.73 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  30.27 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  27.93 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  33.06 
 
 
478 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  31.2 
 
 
483 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  31.55 
 
 
483 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  31.02 
 
 
483 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.57 
 
 
513 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  30.75 
 
 
483 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  30.11 
 
 
496 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 
514 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  31.12 
 
 
483 aa  122  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  30.4 
 
 
481 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  30.67 
 
 
481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  30.38 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  28.88 
 
 
507 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.19 
 
 
469 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  30.11 
 
 
488 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  30.46 
 
 
496 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  31.99 
 
 
491 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  35.82 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.16 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.39 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  29.4 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  28.65 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  28.5 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  31.43 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  31.73 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.73 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  31.73 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.61 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  27.96 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.42 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.96 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  26.68 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  28.42 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  27.96 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  30.98 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  27.96 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  29.37 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  26.01 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  28.72 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.03 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.03 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  31.78 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  27.69 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.18 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  28.44 
 
 
490 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  29.63 
 
 
492 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.7 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  26.83 
 
 
490 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.47 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  29.19 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  29.19 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  29.19 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  29.19 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.85 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  29.19 
 
 
490 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  29.02 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  25.31 
 
 
500 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  25.13 
 
 
492 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  31.06 
 
 
470 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  30.6 
 
 
510 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  29.52 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  26.96 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.92 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.05 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  25.55 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  27.85 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>