252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0263 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  98.63 
 
 		 366 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 366 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.05 
 
 		 383 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.67 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.64 
 
 		 373 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  44.44 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.44 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.73 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.9 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.99 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.84 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  42.07 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  41.57 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  32.03 
 
 		 507 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  30.19 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  28.76 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  29.48 
 
 		 496 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  28.42 
 
 		 505 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.57 
 
 		 525 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  29.08 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.39 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  26.54 
 
 		 482 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  28.45 
 
 		 483 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  28.45 
 
 		 483 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  28.49 
 
 		 483 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  28.28 
 
 		 455 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  27.67 
 
 		 483 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  28.96 
 
 		 483 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.35 
 
 		 464 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  27.87 
 
 		 481 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  27.87 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  27.2 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  27.62 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  32.64 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.63 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  26.92 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  27.76 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.33 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  25.61 
 
 		 485 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.8 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  25.99 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  29.77 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.52 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  29.24 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.17 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.17 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.28 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  28.12 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.12 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  28.12 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  26.03 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.24 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  30.35 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  29.24 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  25.74 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.33 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  27.91 
 
 		 478 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.36 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  27.53 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  27.12 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.23 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  29.13 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.87 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  27.24 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  28.27 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.73 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  27.24 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  27.92 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.6 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  27.92 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.6 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  26.2 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  27.24 
 
 		 486 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  27.24 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.33 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.24 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.6 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  26.2 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.24 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  32.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  32.3 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  26.2 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  28.27 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  26.2 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.6 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  26.2 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  32.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  24.6 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  32.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  32.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  32.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  29.13 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>