280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0530 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  72.54 
 
 		 483 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  86.48 
 
 		 483 aa  870    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  72.54 
 
 		 483 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  69.34 
 
 		 481 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  72.54 
 
 		 483 aa  740    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  87.7 
 
 		 483 aa  886    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  72.54 
 
 		 483 aa  741    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  80.53 
 
 		 483 aa  815    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 488 aa  1004    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  72.54 
 
 		 483 aa  741    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  72.54 
 
 		 483 aa  741    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  98.16 
 
 		 488 aa  991    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  69.75 
 
 		 481 aa  695    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  73.16 
 
 		 483 aa  744    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  72.54 
 
 		 483 aa  740    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  80.33 
 
 		 483 aa  815    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  72.54 
 
 		 483 aa  740    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.03 
 
 		 469 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  43.76 
 
 		 482 aa  435  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  41.63 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  35.97 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.79 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.31 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  38.96 
 
 		 478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  35.1 
 
 		 507 aa  283  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  35.62 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  34.67 
 
 		 505 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.46 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  33.68 
 
 		 481 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 80 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  27.79 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  30.13 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  28.3 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.67 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.61 
 
 		 493 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.36 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  25.75 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.23 
 
 		 499 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.18 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.35 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.67 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  25.88 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.64 
 
 		 505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  28.12 
 
 		 492 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  30.38 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.38 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.65 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.64 
 
 		 383 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  27.14 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.59 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  25.89 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  27.37 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  27.36 
 
 		 492 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  27.39 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  28.3 
 
 		 493 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  28.37 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  28.33 
 
 		 470 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.19 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  31.2 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  27.82 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.7 
 
 		 494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  22.31 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  24.84 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.31 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.31 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  23.45 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.45 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  23.45 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  23.45 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.45 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  27.68 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  26.79 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  27.06 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  27.49 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4796  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.7 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.67 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.49 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  25.4 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  25.05 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  23.45 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  25.92 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  26.13 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.18 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.24 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  25.31 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  27.63 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  29.71 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  25.96 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  25.4 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.4 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.29 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  23.98 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  25.59 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  27.54 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  25.4 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  25.31 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  25.31 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.7 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.95 
 
 		 484 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>