261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1247 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 525 aa  1082    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  56.81 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  55.02 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  51.12 
 
 		 507 aa  487  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  49.02 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.12 
 
 		 513 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  45.16 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  35.71 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  35.71 
 
 		 483 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 485 aa  294  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  36.31 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  35.5 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  35.23 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  35.61 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  35.61 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  35.61 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  36.2 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  35.61 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.61 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  35.61 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  35.61 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  35.61 
 
 		 483 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  36.16 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  33.13 
 
 		 482 aa  279  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.74 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  34.83 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  35.03 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  33.26 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.45 
 
 		 514 aa  213  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.28 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.48 
 
 		 373 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.82 
 
 		 495 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.56 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.33 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.25 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  31 
 
 		 387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31 
 
 		 387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.95 
 
 		 492 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  27.85 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.02 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.96 
 
 		 486 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  24.01 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  25.05 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.05 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  25.05 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  25.05 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.05 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  30.1 
 
 		 386 aa  128  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  27.39 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  25.05 
 
 		 488 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.24 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.86 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  24.86 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.2 
 
 		 386 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.24 
 
 		 488 aa  123  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.05 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.3 
 
 		 488 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.96 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  24.55 
 
 		 498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.38 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.58 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.24 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.52 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  24.46 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.1 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.45 
 
 		 493 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  23.83 
 
 		 490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  24.1 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  25.79 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  24.41 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  29.11 
 
 		 366 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  29.76 
 
 		 485 aa  107  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  26.04 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.84 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.95 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  29.41 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  25.49 
 
 		 496 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  24 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  24 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  25.12 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  24.94 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  24 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.43 
 
 		 505 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  24 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  28.43 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  24.21 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  25.12 
 
 		 459 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  24.34 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  25.25 
 
 		 478 aa  100  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.81 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  22.97 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  23.18 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  27.01 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  23.18 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  23.17 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  22.78 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  22.88 
 
 		 487 aa  96.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  24.63 
 
 		 470 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  24.1 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>