282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2656 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 
514 aa  1028    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  42.14 
 
 
482 aa  319  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  39.68 
 
 
485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  39.42 
 
 
483 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  39.18 
 
 
483 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  36.63 
 
 
481 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  38.16 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.16 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  38.16 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  38.16 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  38.16 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  38.27 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  36.66 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  38.27 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  38.27 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  38.81 
 
 
483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.17 
 
 
469 aa  272  8.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  39.18 
 
 
483 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  38.46 
 
 
488 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  37.41 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  37.98 
 
 
488 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.4 
 
 
513 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  37.34 
 
 
478 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  33.63 
 
 
496 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  36.2 
 
 
481 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  35.15 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  34.75 
 
 
507 aa  220  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  32.71 
 
 
501 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.17 
 
 
525 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.55 
 
 
373 aa  154  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.23 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.47 
 
 
387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  33.16 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.16 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  31.39 
 
 
510 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.38 
 
 
382 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.28 
 
 
386 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.03 
 
 
378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  30.35 
 
 
471 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  31.4 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  30.31 
 
 
378 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  31.48 
 
 
475 aa  120  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.02 
 
 
386 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.36 
 
 
455 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  27.36 
 
 
464 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  30.52 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.99 
 
 
495 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  26.89 
 
 
451 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.81 
 
 
459 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.62 
 
 
497 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.43 
 
 
495 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  30.22 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  29.3 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  28.7 
 
 
485 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.05 
 
 
493 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.55 
 
 
509 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.87 
 
 
499 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.93 
 
 
493 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  26.36 
 
 
496 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.64 
 
 
484 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.65 
 
 
505 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  29.28 
 
 
520 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  29.33 
 
 
473 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  27.68 
 
 
486 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  27.68 
 
 
486 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.34 
 
 
470 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  26.08 
 
 
502 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.43 
 
 
486 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  27.18 
 
 
486 aa  103  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.26 
 
 
460 aa  103  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.26 
 
 
460 aa  103  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  27.18 
 
 
486 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.37 
 
 
476 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  27.18 
 
 
486 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  27.18 
 
 
486 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  27.18 
 
 
486 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2129  Mannitol dehydrogenase domain  31.12 
 
 
482 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  28.71 
 
 
489 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  28.71 
 
 
489 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.46 
 
 
498 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  28.71 
 
 
498 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  28.64 
 
 
489 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  29.21 
 
 
423 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  28.64 
 
 
489 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  28.64 
 
 
489 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  28.64 
 
 
489 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.54 
 
 
493 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  26.26 
 
 
497 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.25 
 
 
485 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  26.79 
 
 
490 aa  97.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.76 
 
 
506 aa  97.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 
528 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  26.79 
 
 
490 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  26.79 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  26.79 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.4 
 
 
488 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  25.4 
 
 
488 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  26.79 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  24.88 
 
 
484 aa  97.1  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>