254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6309 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  95.09 
 
 		 387 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  95.09 
 
 		 387 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.18 
 
 		 378 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  70.32 
 
 		 386 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.98 
 
 		 386 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.45 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.65 
 
 		 373 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.65 
 
 		 382 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.02 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  40.5 
 
 		 378 aa  252  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  45.01 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.73 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  32.54 
 
 		 481 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  29.68 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.25 
 
 		 525 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  30.85 
 
 		 505 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  32 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  31.82 
 
 		 483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  32.62 
 
 		 483 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  31.73 
 
 		 483 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  27.93 
 
 		 482 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  31.55 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  32.79 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  29.79 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.47 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  31.91 
 
 		 483 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.3 
 
 		 513 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  29.84 
 
 		 496 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  30.93 
 
 		 481 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  31.18 
 
 		 488 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  31.2 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  30.91 
 
 		 488 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  29.41 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.46 
 
 		 469 aa  116  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  28.57 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  31.47 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  26.54 
 
 		 492 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  36.23 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  36.23 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  36.23 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  36.23 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  35.5 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  30.61 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  28.84 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  26.05 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.76 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  28.35 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.32 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.91 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.33 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  29.1 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  29.33 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  29.33 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  27.08 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.08 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  27.08 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.62 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  27.08 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  27.08 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.08 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  27.06 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.68 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.68 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  26.81 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.19 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.07 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  24.62 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  30.45 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.42 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  25.19 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  28.38 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  28.38 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  28.38 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  27.81 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  26.15 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  28.38 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  29.11 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.8 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  28.38 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  27.46 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.79 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.51 
 
 		 493 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  24.93 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  26.52 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.67 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  25.87 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  31.3 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.49 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.87 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>