279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2069 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
382 aa  763    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.24 
 
 
373 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.63 
 
 
386 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.84 
 
 
386 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.53 
 
 
378 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.18 
 
 
387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  56.84 
 
 
387 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  56.84 
 
 
387 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  55.53 
 
 
386 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.82 
 
 
383 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  48.02 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.74 
 
 
366 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  44.97 
 
 
378 aa  280  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  32.19 
 
 
496 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  31.27 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.33 
 
 
525 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  30.45 
 
 
507 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  30.65 
 
 
483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  27.82 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  27.7 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.6 
 
 
513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.38 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.89 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  30.39 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  29.87 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  28.46 
 
 
505 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  31.32 
 
 
478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  28.76 
 
 
483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  30.77 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  29.6 
 
 
483 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  30.62 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  27.52 
 
 
501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  29.4 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  29.38 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  30.05 
 
 
488 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.68 
 
 
490 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  28.68 
 
 
490 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.78 
 
 
470 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  30.05 
 
 
498 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  29.78 
 
 
496 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  30.69 
 
 
452 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  34.26 
 
 
451 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  28.42 
 
 
459 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.35 
 
 
464 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.75 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.53 
 
 
493 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  33.01 
 
 
491 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 
497 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.01 
 
 
487 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  29.68 
 
 
423 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  32.18 
 
 
499 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  34.12 
 
 
510 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.41 
 
 
509 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.9 
 
 
494 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  28.5 
 
 
497 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.81 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.93 
 
 
492 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  28.35 
 
 
471 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  30.88 
 
 
493 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  32.94 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.42 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.61 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.8 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.4 
 
 
505 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.29 
 
 
495 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2406  mannitol dehydrogenase domain protein  28.19 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0249546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  26.67 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  26.4 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  25.25 
 
 
495 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.83 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  26.4 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.4 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  26.4 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  26.4 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.4 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.13 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  32.86 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  31.17 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4071  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.541542  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  26.54 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  28.84 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  29.19 
 
 
492 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4009  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3902  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.970231  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3886  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3964  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.58 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866494  normal  0.811691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>