273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4128 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 496 aa  1025    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.02 
 
 		 525 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  54.24 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  51.08 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  51.29 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  47.08 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.62 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  34.55 
 
 		 485 aa  299  7e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  35.37 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  33.48 
 
 		 482 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  35.62 
 
 		 483 aa  276  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  35.68 
 
 		 483 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  35.62 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  34.98 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  34.98 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.98 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  34.95 
 
 		 483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  35 
 
 		 488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  34.98 
 
 		 483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  34.53 
 
 		 481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.19 
 
 		 469 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  34.85 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  34.32 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  33.33 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.63 
 
 		 514 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.51 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.18 
 
 		 373 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.19 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.52 
 
 		 378 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  29.43 
 
 		 378 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  29.87 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.53 
 
 		 386 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.07 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  30.11 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.11 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.84 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  27.48 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.68 
 
 		 459 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.06 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  23.5 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  24.83 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  25.1 
 
 		 490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.06 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.06 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.1 
 
 		 490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  25.5 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  26.24 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.98 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.04 
 
 		 485 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.28 
 
 		 366 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  24.38 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  29.28 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.96 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.25 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.68 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  24.81 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  27.03 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.03 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  27.03 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.03 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  27.03 
 
 		 488 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  26.27 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  25.88 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.03 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  26.56 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  27.44 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  29.39 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  25.36 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  24.41 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  25.41 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  25.3 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5059  mannitol dehydrogenase domain protein  26.61 
 
 		 475 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000272821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.25 
 
 		 498 aa  103  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.53 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  27.27 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  27.27 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  23.68 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  27.17 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  27.84 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  27.17 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  24.52 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  29.06 
 
 		 488 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 		 488 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.63 
 
 		 528 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  25.76 
 
 		 486 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  24.88 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  24.94 
 
 		 502 aa  97.1  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  25.76 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  28.15 
 
 		 487 aa  96.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.76 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  25.76 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.59 
 
 		 509 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  26.32 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  21.53 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  25.76 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>