279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0064 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 481 aa  993    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  69.75 
 
 		 488 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  70.48 
 
 		 483 aa  698    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  95.84 
 
 		 481 aa  952    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  69.58 
 
 		 483 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  70.16 
 
 		 488 aa  694    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  69.23 
 
 		 483 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  69.02 
 
 		 483 aa  690    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  72.5 
 
 		 483 aa  720    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  72.73 
 
 		 483 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.98 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  43.19 
 
 		 482 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  41.51 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  37.26 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  35.37 
 
 		 501 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  35.7 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.66 
 
 		 514 aa  269  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  34.53 
 
 		 496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  33.6 
 
 		 513 aa  266  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.83 
 
 		 525 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  34.03 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  32.77 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  29.55 
 
 		 496 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 80 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.37 
 
 		 373 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  28.04 
 
 		 492 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.1 
 
 		 485 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.71 
 
 		 499 aa  129  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.1 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  28.75 
 
 		 430 aa  128  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.08 
 
 		 378 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  27.02 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.79 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.29 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  25.67 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.39 
 
 		 505 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.36 
 
 		 494 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.93 
 
 		 387 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  24.27 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  30.4 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.4 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  27.54 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  25.36 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  25.36 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  25.85 
 
 		 470 aa  121  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  25.36 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  23.98 
 
 		 486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  23.98 
 
 		 486 aa  120  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  29.44 
 
 		 482 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  26.81 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.99 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  27.93 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  23.98 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  23.98 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  23.98 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  25.15 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.35 
 
 		 486 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  24.51 
 
 		 492 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  30.24 
 
 		 386 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  25.83 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.05 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.05 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.09 
 
 		 486 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  25.93 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  23.09 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  25.93 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.09 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.14 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.3 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  25.93 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  27.03 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  26.01 
 
 		 491 aa  115  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.57 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.14 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  23.57 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  23.57 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.46 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  27.6 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.63 
 
 		 486 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  30.26 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.36 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.79 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  26.67 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  24.54 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  27.29 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.89 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  25.07 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  25.73 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.42 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.8 
 
 		 493 aa  110  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.47 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  25.51 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>