30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1685 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  98.75 
 
 		 483 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  87.5 
 
 		 483 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  81.25 
 
 		 483 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  81.25 
 
 		 483 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  80 
 
 		 483 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  78.75 
 
 		 488 aa  144  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 488 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 483 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 481 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  77.5 
 
 		 481 aa  140  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  70.59 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  43.04 
 
 		 482 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  41.33 
 
 		 485 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  42.42 
 
 		 478 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  37.88 
 
 		 507 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.9 
 
 		 513 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  35 
 
 		 514 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.32 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  36.84 
 
 		 481 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  40 
 
 		 501 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  35.48 
 
 		 505 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  34.38 
 
 		 496 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>