276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0555 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  72.23 
 
 		 483 aa  730    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  80.53 
 
 		 488 aa  815    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  72.23 
 
 		 483 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  72.23 
 
 		 483 aa  730    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  81.78 
 
 		 483 aa  823    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  72.44 
 
 		 483 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  99.38 
 
 		 483 aa  984    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  72.44 
 
 		 483 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  69.23 
 
 		 481 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  80.54 
 
 		 483 aa  814    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 483 aa  993    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  80.12 
 
 		 488 aa  815    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  68.81 
 
 		 481 aa  682    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  72.23 
 
 		 483 aa  734    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  72.44 
 
 		 483 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  72.23 
 
 		 483 aa  730    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  72.23 
 
 		 483 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  55.77 
 
 		 469 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  44.83 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  40.49 
 
 		 485 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  36.17 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.05 
 
 		 513 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.71 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  36.95 
 
 		 478 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  35.23 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  35.62 
 
 		 496 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.42 
 
 		 514 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  34.45 
 
 		 505 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  34.03 
 
 		 481 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  81.25 
 
 		 80 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  28.92 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.92 
 
 		 464 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  28.69 
 
 		 496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.68 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  30.36 
 
 		 430 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.65 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.13 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.82 
 
 		 387 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.95 
 
 		 373 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.54 
 
 		 494 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  31.02 
 
 		 387 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.02 
 
 		 387 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  25.43 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  26.85 
 
 		 499 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.83 
 
 		 459 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.13 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  31.12 
 
 		 378 aa  124  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  26 
 
 		 489 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  27.76 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  29.82 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.88 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.65 
 
 		 383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  28.37 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  25.31 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  25.68 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  25.68 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  25.68 
 
 		 489 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.75 
 
 		 486 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  25.47 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  25.93 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  25.47 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  25.47 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  25.47 
 
 		 489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.88 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.13 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.18 
 
 		 497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  23.06 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  25.99 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  26.17 
 
 		 470 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  25.87 
 
 		 490 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  25.87 
 
 		 490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  25.35 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  24.4 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  25.87 
 
 		 490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  27.19 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  23.43 
 
 		 486 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  23.43 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.7 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  25.67 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  29.55 
 
 		 478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.43 
 
 		 486 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  23.22 
 
 		 486 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.43 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.57 
 
 		 469 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  25.78 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  26.17 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  24.53 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  23.22 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.21 
 
 		 528 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.99 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.99 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  26.92 
 
 		 490 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  24.15 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  23.01 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  23.01 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.67 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  23.01 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.86 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  28.97 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.55 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>