286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3238 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0498  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  82.01 
 
 
469 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2129  putative D-arabinitol dehydrogenase oxidoreductase protein  71.49 
 
 
465 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0344  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
463 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1047  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
463 aa  688    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5916  mannitol dehydrogenase  72.97 
 
 
464 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0703  mannitol dehydrogenase family protein  74.89 
 
 
463 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0730  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  94.89 
 
 
470 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1975  mannitol dehydrogenase-like  71.92 
 
 
464 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2633  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  73.63 
 
 
464 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2585  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  71.92 
 
 
464 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0779102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0643  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
480 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0783605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2609  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  72.35 
 
 
464 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566868  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2478  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
480 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.927953  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0712  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  73.63 
 
 
464 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466238 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0885  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
496 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0130598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0888  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
480 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0224596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2504  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  73.63 
 
 
464 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  0.524531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0091  mannitol dehydrogenase family protein  74.45 
 
 
480 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000701131  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3238  Mannitol dehydrogenase domain  100 
 
 
470 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.794946  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2216  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  58.92 
 
 
463 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1812  putative D-arabinitol 4-dehydrogenase  58.92 
 
 
463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1922  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.71 
 
 
463 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0134  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.16 
 
 
465 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.226672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1112  Mannitol dehydrogenase domain protein  61.35 
 
 
464 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0894  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  59.27 
 
 
467 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3167  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.24 
 
 
468 aa  508  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00309741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5592  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.72 
 
 
474 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1090  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.1 
 
 
476 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.79 
 
 
494 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  40.05 
 
 
491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.04 
 
 
491 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.32 
 
 
491 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  40.32 
 
 
491 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.68 
 
 
491 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.09 
 
 
505 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  37.76 
 
 
497 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  39.69 
 
 
477 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.69 
 
 
477 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  39.41 
 
 
493 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  36.18 
 
 
493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  40.55 
 
 
492 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  39.48 
 
 
503 aa  253  7e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  35.44 
 
 
497 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.1 
 
 
493 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3848  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.99 
 
 
494 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.611991  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  34.34 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.34 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  32.89 
 
 
484 aa  245  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1133  Mannitol dehydrogenase domain  36.93 
 
 
486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  37.37 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.62 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2907  mannitol dehydrogenase-like  38.36 
 
 
499 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554349 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.53 
 
 
506 aa  243  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.91 
 
 
492 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4739  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.11 
 
 
472 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0950062  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  35.63 
 
 
497 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.01 
 
 
494 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3572  mannitol 2-dehydrogenase  32.8 
 
 
495 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4177  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.75 
 
 
487 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.34 
 
 
528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  37.28 
 
 
499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  39.11 
 
 
506 aa  233  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  32.68 
 
 
500 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.63 
 
 
460 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.63 
 
 
460 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.77 
 
 
659 aa  233  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0969  mannitol dehydrogenase domain protein  39.85 
 
 
499 aa  233  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.124507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5663  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.91 
 
 
509 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733675 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  32.94 
 
 
502 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  34.6 
 
 
493 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.15 
 
 
485 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2459  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  34.02 
 
 
589 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3727  mannitol dehydrogenase Rossman-like  37.66 
 
 
509 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4641  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.66 
 
 
509 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3446  Mannitol dehydrogenase domain  34.67 
 
 
493 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  32.54 
 
 
520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3962  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.68 
 
 
488 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25102  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  38.98 
 
 
470 aa  225  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  34.77 
 
 
492 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  37.72 
 
 
510 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  34.62 
 
 
492 aa  223  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  37.8 
 
 
496 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  37.37 
 
 
485 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  35.07 
 
 
490 aa  219  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  35.98 
 
 
485 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  38.13 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.97 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  37.11 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.69 
 
 
493 aa  216  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  36.41 
 
 
493 aa  216  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  35.68 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2666  Mannitol dehydrogenase domain protein  37.13 
 
 
499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  35.91 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  35.91 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  35.91 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  35.91 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.34 
 
 
497 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  35.91 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  34.28 
 
 
498 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  35.75 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>