272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2842 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 507 aa  1048    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  50.31 
 
 		 505 aa  498  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  51.12 
 
 		 525 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  51.08 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  46.68 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.49 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  43.46 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  35.1 
 
 		 488 aa  283  8.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  35.61 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  34.67 
 
 		 488 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  35.1 
 
 		 483 aa  279  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  35.58 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  35.23 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  33.75 
 
 		 482 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  35.16 
 
 		 485 aa  276  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  35.33 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  35.33 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  35.33 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  35.33 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  35.33 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  35.12 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  35.12 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  35.12 
 
 		 483 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  35.7 
 
 		 481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.67 
 
 		 469 aa  266  8.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  35.06 
 
 		 483 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  35.28 
 
 		 481 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  33.06 
 
 		 478 aa  259  9e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.75 
 
 		 514 aa  211  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  25.29 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.27 
 
 		 373 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  31.48 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  26.92 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.37 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  25.8 
 
 		 489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.71 
 
 		 495 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  26.41 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.7 
 
 		 495 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.61 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.73 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  27.23 
 
 		 498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  26.4 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  27.89 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  25.1 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  24.85 
 
 		 489 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  29.22 
 
 		 386 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  26.17 
 
 		 455 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  32.03 
 
 		 366 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  27.67 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.44 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  27.34 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  31.88 
 
 		 366 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.96 
 
 		 493 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  25.15 
 
 		 510 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.13 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.13 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.99 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  26.84 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  25.32 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.15 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  28.88 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  26.87 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.88 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.41 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.34 
 
 		 505 aa  117  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  24.1 
 
 		 488 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  24.8 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  24.8 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.8 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.8 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  27.97 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  24.8 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.54 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02815  Mannitol 2-dehydrogenase (M2DH)(MDH)(EC 1.1.1.67) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B9G5]  24.59 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00260323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  23.65 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  26.4 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.1 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.35 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  27.57 
 
 		 458 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  24.8 
 
 		 488 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  23.87 
 
 		 493 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.7 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  24.59 
 
 		 488 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.67 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  24.59 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  24.7 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.7 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  24.02 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  24.52 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  24.04 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  23.81 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  23.83 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  26.86 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>