275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0173 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
383 aa  762    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.16 
 
 
373 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.27 
 
 
382 aa  326  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.89 
 
 
386 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.37 
 
 
386 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  49.32 
 
 
366 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  46.51 
 
 
386 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.05 
 
 
366 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.5 
 
 
378 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.02 
 
 
387 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  46.4 
 
 
387 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.4 
 
 
387 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  46.92 
 
 
378 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  31.51 
 
 
496 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  30.67 
 
 
481 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.56 
 
 
525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  29.76 
 
 
505 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  28.5 
 
 
501 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  29.52 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  32.8 
 
 
478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  28.61 
 
 
507 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  28.68 
 
 
485 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  34.23 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.08 
 
 
513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  30.27 
 
 
483 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  32.02 
 
 
483 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  31.99 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  31.9 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  31.52 
 
 
483 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  31.37 
 
 
488 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  30.65 
 
 
483 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  30.39 
 
 
483 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  30.81 
 
 
483 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  31.64 
 
 
488 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.36 
 
 
469 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  29.84 
 
 
497 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.25 
 
 
488 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  27.39 
 
 
486 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  28.46 
 
 
496 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  29.97 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.86 
 
 
464 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  27.39 
 
 
486 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.61 
 
 
497 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  27.39 
 
 
486 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  27.39 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  27.39 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.17 
 
 
495 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  33 
 
 
548 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.55 
 
 
493 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27 
 
 
490 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  27 
 
 
490 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  32.55 
 
 
471 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.19 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  29.11 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  29.2 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  29.11 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  29.11 
 
 
488 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.59 
 
 
497 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  27.13 
 
 
486 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.13 
 
 
486 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  27.13 
 
 
486 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  29.06 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  29.11 
 
 
488 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  28.36 
 
 
452 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  31.58 
 
 
470 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.62 
 
 
495 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.98 
 
 
493 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  30.47 
 
 
498 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  29.95 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  28.69 
 
 
488 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.42 
 
 
488 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  26.03 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  27.25 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.25 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  27.25 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  29.48 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  27.66 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.72 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  26.72 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  27.25 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  29.32 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.68 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  27.25 
 
 
488 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  27.25 
 
 
490 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  26.88 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  25 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0788  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.91 
 
 
486 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>