More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1810 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1810  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  638    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1023  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3655  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2875  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0213  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0531  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0697  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.191439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2656  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3293  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0677  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06732  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000824  transcriptional regulator LysR family  36.01 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00283098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0274  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37930  LysR family transcriptional regulator protein  35.89 
 
 		 308 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2975  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0997  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1630  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1813  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139203  normal  0.0296636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2653  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.66408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2531  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.389044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2538  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2560  transcriptional regulator, LysR family protein  32.54 
 
 		 299 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2364  regulatory protein, LysR  33.11 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3476  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2292  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000123532  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2430  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00774  transcriptional regulator, LysR family protein  31.09 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2297  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252143  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2221  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572523  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0271  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0648353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  26.18 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  26.18 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  26.18 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  26.18 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  26.18 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  27.61 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.7 
 
 		 328 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0879  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4360  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 299 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623991  normal  0.557987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5176  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.05 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  24.16 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0357  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.449267  unclonable  0.0000000664485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2590  nitrogen assimilation transcriptional regulator  24.43 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  24.07 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  24.48 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 332 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  25.43 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  24.07 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  23.89 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2765  transcriptional regulator, LysR family  25.67 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  27.42 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4429  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353494  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1096  transcriptional regulator, LysR family  25.75 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.816594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3781  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.852232  normal  0.126897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  25.27 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1366  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.320453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2361  transcriptional regulator, LysR family  24.7 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.369632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0910  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>