117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1683 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  48.79 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  42.66 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  48.06 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  48.29 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  40.43 
 
 		 290 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  41.67 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  38.89 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  43.97 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  39.74 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  36.29 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  34.26 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  33.2 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  33.19 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.2 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  33.83 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  30.33 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  33.19 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  31.5 
 
 		 280 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  32.63 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  30.98 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  31.17 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  32.28 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  32.48 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  31.54 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  29.66 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  32.71 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  28.83 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  31.38 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.46 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.63 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.56 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  30.08 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  30.12 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.98 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  29.71 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.39 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  32.64 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.17 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  36.63 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.24 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  32.08 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.76 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.57 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  29.54 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.33 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.9 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  33.6 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.61 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  26.69 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.35 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  30.86 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.41 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.33 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25.2 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  26.69 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  26.69 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  26.69 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  26.69 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  29.37 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  25.74 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  26.27 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  27.12 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.74 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.85 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  27.12 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  22.71 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.94 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.08 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  29.64 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  27.53 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.4 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  31.56 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  30.42 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  28.23 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  29.25 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  32.77 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  22.78 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  21.74 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  32.54 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  25.3 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  27.66 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  38.25 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  28.84 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  29.78 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  27 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  30.49 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  26.46 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.8 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  27.17 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  27.75 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  26.32 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  26.17 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.32 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.05 
 
 		 245 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>