77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1530 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  493  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  54.92 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  37.74 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  41.32 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  39.82 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  35.25 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  41.18 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  39.92 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  34.88 
 
 		 286 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  34.96 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  31.42 
 
 		 306 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  32.64 
 
 		 270 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  38.89 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  34.57 
 
 		 324 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  33.83 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  34.75 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  35.29 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  32.3 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  30.3 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.89 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  28.67 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  29.5 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  30.04 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  28.68 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.46 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.39 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  26.5 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  31.98 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  27.61 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.61 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  32 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.8 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  26.54 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  32.04 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  29.51 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  31.91 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  35.34 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  29.28 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.43 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  25.69 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  30.77 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.2 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  42.05 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  28.24 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.78 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  38.96 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.72 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  26.15 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  36.67 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  25.77 
 
 		 301 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.14 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  39.02 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  31.44 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  39.02 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  39.02 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.84 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  28.35 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  37.35 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  39.74 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  38.46 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  39.02 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  34 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  31.76 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  24.81 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  24.42 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  24.81 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  24.81 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  37.5 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  37.93 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  30.51 
 
 		 251 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  22.91 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  26.98 
 
 		 305 aa  42  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>