153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0528 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  99.6 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  79.12 
 
 
252 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  62.04 
 
 
261 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  53.06 
 
 
263 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  55.26 
 
 
233 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  55.71 
 
 
250 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  55.4 
 
 
251 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  57.75 
 
 
233 aa  248  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  55.66 
 
 
244 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  55.2 
 
 
229 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  56.67 
 
 
250 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  58.85 
 
 
281 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  44.71 
 
 
268 aa  224  8e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  50.67 
 
 
278 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  50.22 
 
 
278 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  54.79 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  53.46 
 
 
285 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  52.53 
 
 
287 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  50 
 
 
237 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  45.53 
 
 
282 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  44.31 
 
 
269 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  44.31 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  54.08 
 
 
231 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  42.69 
 
 
260 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  44.53 
 
 
256 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  43.15 
 
 
256 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  43.33 
 
 
256 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  40.5 
 
 
264 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  44.39 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  41.52 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  45.41 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  40.08 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  40.08 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  40.09 
 
 
243 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  40.91 
 
 
253 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  38.06 
 
 
250 aa  158  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  38.56 
 
 
250 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  37.71 
 
 
244 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  39.25 
 
 
247 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  37.67 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  35.4 
 
 
247 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  33.05 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  35.22 
 
 
259 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  32.92 
 
 
249 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  33.47 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  33.2 
 
 
250 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  32.24 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  33.88 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  31.33 
 
 
268 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  34.2 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  33.91 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  34.2 
 
 
223 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  31.6 
 
 
220 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  31.74 
 
 
224 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  30.87 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  28.64 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.05 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  28.14 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  28.88 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  29.23 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.58 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  26 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  25.45 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  25.89 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  28.9 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.76 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  30.18 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  27.14 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  28.7 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  28.7 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  33.09 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  28.99 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  24.9 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.06 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.99 
 
 
290 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  25.62 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.18 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.18 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.18 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  32.81 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  31.16 
 
 
342 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  29.03 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  27.31 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  26.98 
 
 
238 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  27.76 
 
 
292 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  24.29 
 
 
213 aa  55.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.92 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  28.28 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  28.03 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  28.28 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  26.23 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  28.28 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  25.51 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  27.62 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  31.4 
 
 
304 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>