105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0164 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  52.06 
 
 		 253 aa  225  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  40.24 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  37.74 
 
 		 252 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  37.36 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  39.18 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  36.19 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  31.66 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  36.07 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  36.6 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  38.52 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  31.78 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  34.51 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  38.78 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  33.09 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  31.18 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  29.96 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  32.64 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  31.64 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  33.09 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  30.08 
 
 		 311 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  30.31 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  31.06 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  30.04 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  33.06 
 
 		 283 aa  89.7  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  32.8 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  29.92 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  33.67 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  31.6 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  31.25 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  27.96 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  29.34 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.08 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  25.81 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  26.01 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  26.86 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  36.09 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  25.47 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  30.97 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  30.97 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  30.97 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  30.97 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  27.83 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  30.97 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  31.61 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  28.51 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  25.89 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  25.89 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  25.89 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  28 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  26.32 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  26.34 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25.64 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  26.27 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  27.66 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.39 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  25.29 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  30.32 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.17 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.97 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.73 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  25.49 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.39 
 
 		 347 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  43.75 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  26.25 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  26.83 
 
 		 347 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  28.34 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  26.86 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  26.45 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  40.79 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.13 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  39.47 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  28.9 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  29.89 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  26.46 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.07 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  29.09 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  30 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  28.97 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  29.67 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  28.99 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  24.58 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  38.16 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.39 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  24.15 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.76 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  42.11 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  26.32 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  35.53 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  25.94 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  25.76 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  28.31 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  25.69 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  28.67 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  29.56 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>