82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2325 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  591  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  45.79 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  40.53 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  40.81 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  38.74 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  33.9 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  33.88 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  36.86 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  38.24 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  33.88 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  33.09 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.58 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  30.2 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.94 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.83 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  29 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  26.36 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  26.98 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  26.47 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  26.71 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  28.51 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.15 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.73 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  27.76 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  29.1 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  28.46 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.15 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  28.46 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  28.46 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.89 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.51 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.31 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  29.02 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.03 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  28.87 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  26.4 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.88 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  28.9 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  26.6 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.29 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.62 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.68 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.71 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  30.18 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.57 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  28.68 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.87 
 
 		 234 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  32.7 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  26.44 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.29 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.08 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.86 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  30.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  30.22 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  26.98 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  33.87 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  29.5 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  27.63 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  36.21 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  29.5 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  28.19 
 
 		 223 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  24.91 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  27.35 
 
 		 220 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  26.38 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  31.48 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.62 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.05 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.29 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  26.77 
 
 		 213 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.41 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  28 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  31.62 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.44 
 
 		 254 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  26.75 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  29.37 
 
 		 245 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>