144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2280 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  42.74 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  44.18 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  37.46 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  41.13 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  32.95 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  35.2 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  29.37 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  30.47 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  34.8 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  33.59 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  32.32 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  32.38 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  33.1 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  32.22 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  31.21 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  30.12 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  30.39 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  31.75 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  28 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  30.28 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  30.67 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  34.23 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.3 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  30.62 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  31.71 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  28.52 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  29.2 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  32.78 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  29.55 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  31.2 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  32.82 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  30.68 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  31.25 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  30.25 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  27.63 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.39 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.76 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  29.15 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  26.94 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  28.88 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.55 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.88 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  29.15 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  29.15 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  29.15 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  29.15 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.88 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.8 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.7 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  28.45 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.16 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.59 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  27.62 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  29.26 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  28.91 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  27.68 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.16 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.7 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.4 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  30.52 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.93 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  26.29 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  29.39 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.19 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.82 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  32.88 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  33.08 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.04 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  31.03 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.95 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  25.96 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  26.69 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.06 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.87 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27.57 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  31.06 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  31.06 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  27.23 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  31.58 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  28.42 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  28.99 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  29.8 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  32.14 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  31.88 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  31.88 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  26.99 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  28.85 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  25.78 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.08 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  27.94 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  31.19 
 
 		 250 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  29.73 
 
 		 210 aa  53.1  0.000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  25.66 
 
 		 284 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>