98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0828 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  54.92 
 
 		 252 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  38.55 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  31.66 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  35.38 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  32.44 
 
 		 303 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  33.09 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  38.76 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  35.27 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  30.54 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  37.25 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  36.43 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  33.47 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  31.64 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  33.58 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  31.62 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  36.15 
 
 		 253 aa  95.5  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  33.09 
 
 		 320 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  31.96 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  31.71 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  31.01 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  30.37 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  32.98 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  34.22 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  29.86 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  27.87 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.73 
 
 		 314 aa  72  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  38.24 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  29.41 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  29.41 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  29.2 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  30.65 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  30.77 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  31.13 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  30 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  28.94 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  28.73 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  28.74 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.31 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  31.95 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  37.13 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  30.08 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  26.1 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  25.76 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.01 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.31 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  31.41 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  34.44 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  28.65 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  44.9 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  29.61 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  31.13 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  42.86 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  31.52 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  28.7 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  27.27 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.86 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  31.01 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.61 
 
 		 248 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  25.73 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  28.18 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.38 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  31.14 
 
 		 230 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  29.45 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  27.49 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  39.36 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  29.24 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  31.62 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  29.84 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  26.84 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  26.84 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  26.49 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.5 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  26.34 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  26.67 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  26.59 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  27.19 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  26.72 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  24.51 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  27.01 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.01 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  29.57 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  27.92 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.2 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  23.72 
 
 		 224 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  43.75 
 
 		 222 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.54 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.52 
 
 		 253 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  27.66 
 
 		 250 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>