95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3046 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  43.5 
 
 
286 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  40.42 
 
 
279 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0645  hypothetical protein  37.21 
 
 
311 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.214071  normal  0.230839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  37.75 
 
 
276 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0695  hypothetical protein  42.15 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  35.18 
 
 
306 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  36.59 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  34.77 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  33.07 
 
 
286 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  37.3 
 
 
271 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2871  membrane protein  31.75 
 
 
298 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156461  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  36.51 
 
 
324 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  35.69 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  32 
 
 
293 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  34.01 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07660  hypothetical protein  34.2 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66044  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  34.91 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16490  hypothetical protein  32.74 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.888774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  31.2 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  31.06 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  25.7 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  29.36 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  29.29 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  29.8 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.08 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.75 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  27.83 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  28.39 
 
 
319 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  27.31 
 
 
304 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.27 
 
 
290 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  28.63 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  28.63 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  28.63 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  32.89 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  34.51 
 
 
272 aa  59.3  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  26.86 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  25.33 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  34.71 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  27.62 
 
 
327 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.31 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.51 
 
 
314 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  27.19 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  28.14 
 
 
301 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  34.55 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  28.83 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.85 
 
 
246 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.12 
 
 
237 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  28.31 
 
 
348 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28.12 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28.12 
 
 
342 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.12 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.2 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.38 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  28.4 
 
 
303 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  27.12 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.55 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  25.99 
 
 
359 aa  52.4  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  24.7 
 
 
247 aa  52  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  22.69 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  31.53 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  28.96 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  29.66 
 
 
294 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.07 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  25.81 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  26.95 
 
 
280 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.88 
 
 
347 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.96 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  28.99 
 
 
345 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  28.47 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.49 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  25.12 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.02 
 
 
347 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  25.93 
 
 
248 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.1 
 
 
258 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  32.35 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  35.29 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  25.35 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  26.94 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  26.53 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  35.45 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  24.14 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  30.51 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  24.46 
 
 
295 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  32.23 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  25.73 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.01 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27.8 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  30.61 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  28.28 
 
 
243 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>