148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0131 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  39.71 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  37.21 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  134  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  37.32 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  35.1 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  37.07 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  39.61 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  40.51 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  41.03 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  31.68 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  32.08 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  29.38 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  35.03 
 
 		 246 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.13 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  35.02 
 
 		 333 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  35.65 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  34.74 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  36.92 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  37.98 
 
 		 255 aa  104  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.93 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  36.28 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32.73 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  38.31 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  33.17 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32.58 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.48 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  37.44 
 
 		 251 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  33.68 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.03 
 
 		 258 aa  95.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.57 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.48 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  34.34 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  36.32 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.03 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  31.65 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  28.64 
 
 		 237 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.64 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.64 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  34.09 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  27.57 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  34.27 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  27.2 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  27.15 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.5 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  29.47 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  27.67 
 
 		 347 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.67 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  26.26 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  31.72 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  28.32 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  27.73 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  31.46 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  30.7 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  31.46 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  30.05 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  30.52 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  30.52 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  31.74 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  34.43 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  27.83 
 
 		 251 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  28.91 
 
 		 303 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  29.11 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  29.24 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  29.26 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  28 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  28 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  28 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  28 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  28 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  30.05 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  26.15 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.1 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.73 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  26.94 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  32.57 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  26.92 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  28.44 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  27.15 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  28.05 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  26.42 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  28.22 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  28.57 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  27.23 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  27.15 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  24.67 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  33 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  33.67 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  28.46 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  27.23 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  32.33 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  29.72 
 
 		 263 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  28.51 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3046  hypothetical protein  34.55 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>