123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0316 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  56.25 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  31.96 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  31.14 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  37.1 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  35.06 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  39.18 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  38 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.91 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  32.09 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  34.96 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.91 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  31.71 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.38 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  33.75 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  31.71 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.1 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  35.5 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30.28 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.44 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  30.26 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  35.74 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  28.83 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  31.11 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  30.34 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.36 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  31.86 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.28 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  28.95 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  31.96 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.83 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  34.01 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  36.71 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  31.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  30.45 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  31.51 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  29.18 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  32.14 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  31.51 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  32.65 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  29.6 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  29.18 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  31.11 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.75 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.12 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  31.63 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  32.76 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  31.62 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  29.17 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  33.17 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  31.62 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  27.16 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  31.12 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  32.79 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  25.21 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  29.22 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  28.83 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  28.76 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  33.76 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  27.63 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  27.63 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  31.51 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  31.51 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  28.39 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  26.89 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  28.82 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  30.04 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.82 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  32.89 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  28.68 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  26.96 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  30.97 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.92 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  28.98 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.56 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  29.65 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.73 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  31.37 
 
 		 311 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  31.37 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  28.02 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  26.84 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  29.32 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  27.78 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  31.82 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  26.91 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  28.06 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  31.6 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  28.27 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  27.38 
 
 		 314 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  22.54 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  30 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>