59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3882 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0920  hypothetical protein  38.05 
 
 		 194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0661365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1399  SurF1 family protein  37.77 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  32.44 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  34.43 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  33.48 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  32.85 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  27.2 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  31.28 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  28.57 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  27.27 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  31.22 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  31.22 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  29.61 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  25.31 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  24.77 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  29.67 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  23.79 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  24.9 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  23.91 
 
 		 264 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  25.96 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  29.39 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  24.22 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  29.61 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  26.96 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  28.45 
 
 		 359 aa  48.5  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  26.45 
 
 		 250 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  29.09 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  27.07 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  25.34 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  27.12 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  31.25 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  30.7 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  27.43 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  30.4 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  24.48 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  30.7 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  24.48 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  30.7 
 
 		 347 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  25.88 
 
 		 256 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  28.71 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  23.96 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  23.81 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  29.46 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  25.5 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.18 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  25.86 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  28.51 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  30.36 
 
 		 347 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  22.08 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  24.89 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  23.87 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  29.46 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  25.12 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  26.27 
 
 		 267 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  25.81 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  22.94 
 
 		 333 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  27.85 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>