88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4003 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  51.19 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  56.96 
 
 		 231 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  51.84 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  46.55 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  54.31 
 
 		 251 aa  242  6e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  52.59 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  52.44 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  51.02 
 
 		 254 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  52.03 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  46.69 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  48.98 
 
 		 263 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  44.6 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  46.69 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  46.98 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  46.19 
 
 		 255 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  46.51 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  44.29 
 
 		 234 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  32.07 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  31.08 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  30.8 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.99 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.52 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.91 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.35 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.16 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  28.5 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  28.36 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  26.23 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  28.37 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.26 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.9 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.18 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  27.44 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  26.67 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  25.41 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  25.57 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  26.8 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  26.25 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  26.04 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  25.83 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  27.89 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  24.44 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  24.66 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  24.66 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  24.66 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  24.66 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  24.66 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.6 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.94 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  24.66 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  23.32 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  24.2 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.76 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  23.43 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  24.36 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  24.2 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  23.5 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  28.19 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  26.61 
 
 		 238 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  24.36 
 
 		 237 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  22.64 
 
 		 347 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  22.78 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  26.46 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  24.39 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.49 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  23.93 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  24.89 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  24.78 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  23.93 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  24.22 
 
 		 210 aa  50.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.31 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  23.98 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  26.25 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  25.31 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  28.75 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  23.72 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.49 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  21.4 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  25.79 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  23.92 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  21.84 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  23.38 
 
 		 223 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>