89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3796 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  95.38 
 
 		 303 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  95.71 
 
 		 303 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  77.22 
 
 		 281 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  63.96 
 
 		 254 aa  334  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  63.96 
 
 		 254 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  63.25 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  62.9 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  59.14 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  50.2 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  44.48 
 
 		 275 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  46.69 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  46.1 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  47.49 
 
 		 263 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  46.34 
 
 		 231 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  42.51 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  36.5 
 
 		 255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  40.53 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  27.24 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.46 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.65 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30.13 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  26.72 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.36 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  31.02 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  27.46 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  29.89 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.39 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.75 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  24.69 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  27.48 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  22.51 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  23.75 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  23.63 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  24.69 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.3 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  23.63 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  27.15 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  26.01 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  30.62 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  30.94 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  25.42 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.39 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  23.85 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  24.03 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  25.76 
 
 		 228 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  23.21 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  26.75 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.39 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  23.33 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  26.51 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  24.88 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  27.64 
 
 		 223 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.25 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  26.58 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  26.39 
 
 		 249 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  25.22 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  25.22 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  25 
 
 		 256 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  25.22 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  25.22 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  22.36 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  26.43 
 
 		 237 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  29.18 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  24.24 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  28.64 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  23.31 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  25.22 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.21 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  26.59 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  24.17 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  29.46 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.34 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  28.03 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  24.55 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  23.89 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.72 
 
 		 333 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  28.17 
 
 		 243 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  23.46 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  22.92 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  25.1 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  25.1 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  24.48 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  25.59 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  23.93 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  24.19 
 
 		 229 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>