142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2853 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  98.84 
 
 		 258 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  60 
 
 		 283 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  51.13 
 
 		 311 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  56.47 
 
 		 223 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  55.83 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  51.97 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  54.85 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  52.87 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  51.44 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  50.21 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  42.62 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  42.86 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  43.04 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  43.38 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  42.15 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  42.67 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  43.11 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  41.78 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  42.67 
 
 		 237 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  42.22 
 
 		 237 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  41.74 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  40.54 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  40.91 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  40.09 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  40.09 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  40.09 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  40.09 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  39.91 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  39.74 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  38.08 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  39.19 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  38.7 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  35.43 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  34.39 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  36.16 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  32.33 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  33.03 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  31.48 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  31.02 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  29.58 
 
 		 333 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  30.6 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  29.75 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  30.61 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  30.61 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  29.92 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  29.22 
 
 		 254 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  30.42 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.2 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.17 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  28.91 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  30.54 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  23.32 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  30.13 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  30.09 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  30.05 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  27.7 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  30.8 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  31.92 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  27.69 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  31.95 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  30.28 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  26.25 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  28.09 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  28.81 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  30.52 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  29.72 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  29.72 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  27.23 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  31.38 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  31.12 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  29.1 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  31.23 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  27.24 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  31.03 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  31.82 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  29.21 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  22.58 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  27.06 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  29.21 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  25.58 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  26.47 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.32 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  24.42 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  23.75 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  30.08 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  26.47 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  26.97 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  26.34 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  29.05 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  30.6 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  29.84 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  26.88 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  26.69 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  28.63 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>