171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1465 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  100 
 
 		 228 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  41.51 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  39.35 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  41.15 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  39.71 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  34.86 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  34.86 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  34.86 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  34.86 
 
 		 347 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  35.32 
 
 		 347 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  34.4 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  33.49 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  34.35 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  33.93 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  32 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.05 
 
 		 258 aa  118  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.48 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  32.59 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.76 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  34.16 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  34.29 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  33.8 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  33.5 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  33.5 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  33.5 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  33.5 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.95 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  37.62 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  33.01 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  33.5 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  30.49 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  32.52 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  33.33 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  34.76 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  33.03 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  30.6 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  27.8 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  33.18 
 
 		 295 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.35 
 
 		 242 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  32.26 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  32.11 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  34.02 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  34.02 
 
 		 264 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  31.51 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  29.82 
 
 		 253 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  33.84 
 
 		 311 aa  95.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  30.09 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  31.28 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  30.4 
 
 		 333 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  30.88 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  32.99 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.96 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  27.98 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.32 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  32.63 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.39 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  28.82 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  29.44 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  31.22 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  27.75 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  24.44 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.58 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  30.09 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  31.25 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  27.75 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  28 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  27.82 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  33.48 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  30.04 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  25.11 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  30.62 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  27.27 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  28.19 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  29.36 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  27.65 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  27.43 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  26.94 
 
 		 324 aa  68.6  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  28.69 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  27.19 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.99 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  31.8 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  29.05 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  29.09 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  26.82 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  34.59 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  24.46 
 
 		 308 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  29 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  29.15 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  28.44 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  28 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  29.15 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  27.73 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  27.19 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  28.32 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  28.57 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  28.7 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  27.07 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>