111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4316 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  98.43 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  97.24 
 
 
254 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  96.85 
 
 
254 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  74.5 
 
 
251 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  63.96 
 
 
303 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  63.6 
 
 
303 aa  311  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  65.19 
 
 
303 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  63.27 
 
 
281 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  51.93 
 
 
252 aa  245  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  51.25 
 
 
251 aa  241  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  51.02 
 
 
308 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  48.78 
 
 
275 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  50.9 
 
 
231 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  46.12 
 
 
263 aa  224  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  45.22 
 
 
234 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  41.15 
 
 
255 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  42.48 
 
 
236 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  31.09 
 
 
272 aa  99  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  29.51 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  32.1 
 
 
251 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.61 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  30 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  30 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  28.51 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.26 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  30.13 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  32.2 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  27.7 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  32.54 
 
 
234 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  24.31 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  26.27 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  30.52 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.99 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.56 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  27.27 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  28.71 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  30 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  27.59 
 
 
246 aa  72  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  29.26 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  28.51 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  28.98 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  28.24 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  25.56 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  27.64 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  27.44 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  27.44 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  27.44 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  27.44 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  27.7 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  28.05 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  28.64 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.57 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.94 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  24.65 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  25.76 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  25.76 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  25.76 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  28.51 
 
 
333 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  28.78 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  28.23 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  25.76 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  26.52 
 
 
347 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  25.33 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  26.91 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.03 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  28.14 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  25.58 
 
 
288 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.9 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  27.96 
 
 
359 aa  59.3  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  26.43 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  23.38 
 
 
245 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  27.03 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  25.63 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  29.63 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  26.27 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  24.88 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  24.69 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  24.23 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  24.79 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  27.12 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  31.49 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  29.41 
 
 
311 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  25 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  24.78 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  23.6 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  23.6 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  23.6 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  23.14 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  24.77 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  24.6 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  25 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  22.37 
 
 
210 aa  47  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  26.45 
 
 
249 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  28.48 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0316  hypothetical protein  31.96 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  25.2 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.806351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>