98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0120 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  53.62 
 
 		 231 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  52.5 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  51.84 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  51.45 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  51.25 
 
 		 254 aa  241  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  50.42 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  51.25 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  50.83 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3995  hypothetical protein  54.42 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  50.62 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3796  hypothetical protein  51.03 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  49.8 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  47.2 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  49.55 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  42.31 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  44.54 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  41.63 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  30.92 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.09 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  32.13 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  30.58 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  29.75 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.86 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  28.11 
 
 		 223 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  33.04 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  29.68 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.45 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  28.07 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  29.49 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.69 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  29.63 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  29.49 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  28.07 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  29.74 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  28.51 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  27.31 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  28.19 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  29.49 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  27.75 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.31 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  28.38 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  29.36 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  27.75 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  28.57 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27.75 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  27.46 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  31.2 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  24.9 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  28.38 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  31.28 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  27.6 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  28.98 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.53 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  27.64 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  27.98 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  27 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.45 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.42 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  29.77 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.89 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.71 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  26.87 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  30.04 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  26.48 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  29.33 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  24.32 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.09 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  27.76 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  25.71 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  26.2 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  27.52 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1043  hypothetical protein  26.27 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  27.92 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  25.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  26.34 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  27.85 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  21.05 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  27.59 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  25 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  23.77 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  26.19 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  21.85 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  24.4 
 
 		 288 aa  45.4  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  26.39 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  24.9 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.33 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  25.42 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  24.51 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  42.31 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>