134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3150 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3150  SURF1 family protein  100 
 
 
224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0619  hypothetical protein  54.22 
 
 
223 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  53.33 
 
 
223 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  53.33 
 
 
223 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1145  hypothetical protein  53.27 
 
 
233 aa  217  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4316  SURF1 protein  48.42 
 
 
223 aa  214  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113316  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2331  SURF1 family protein  49.55 
 
 
220 aa  204  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.486362  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0588  Surfeit locus 1 family protein  33.05 
 
 
264 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0160113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  34.65 
 
 
253 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  35.41 
 
 
246 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  37.67 
 
 
254 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  31.92 
 
 
250 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3555  Surfeit locus 1 family protein  34.7 
 
 
252 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  33.48 
 
 
249 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  34.03 
 
 
256 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  33.05 
 
 
249 aa  99  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  33.19 
 
 
256 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  32.89 
 
 
233 aa  99  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0076  SurF1 family protein  32.05 
 
 
268 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  34.82 
 
 
253 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  31.74 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  32.27 
 
 
278 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  32.77 
 
 
256 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  31.74 
 
 
253 aa  95.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6212  SurF1 family protein  30.3 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  32.64 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  31.98 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  32.48 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0906  Surfeit locus 1 family protein  29.64 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  29.47 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  33.33 
 
 
230 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  31.8 
 
 
281 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0768  surfeit locus 1  30.8 
 
 
250 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211943  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  33.04 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4581  surfeit protein  29 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3456  Surfeit locus 1  28.29 
 
 
249 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1048  cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  29.61 
 
 
241 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.520132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  30.59 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1735  Surfeit locus 1 family protein  33.05 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0821  putative surfeit 1  30.25 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  31.25 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  32.09 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1250  Surfeit locus 1 family protein  34.1 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  29.18 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  31.22 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  33.96 
 
 
287 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4794  Surfeit locus 1  29.86 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4368  Surfeit locus 1 family protein  29.44 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  28.76 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1504  Surfeit locus 1  28.57 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.323689  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5989  Surfeit locus 1 family protein  32.5 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  31.53 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4050  Surfeit locus 1 family protein  29.63 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  30.69 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2227  SURF1 family protein  31.31 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.752396  normal  0.0142027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3882  hypothetical protein  32.85 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  30.25 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0835  putative surfeit 1 protein  27.6 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  25.78 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0526  Surfeit locus 1 family protein  29.41 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0259384  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2219  Surfeit locus 1 family protein  28.51 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127472  normal  0.185361 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1081  SURF1 family protein  25.63 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.5204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5731  Surfeit locus 1 family protein  33.66 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.0198979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2288  Surfeit locus 1  25.11 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  29.47 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.49 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  29.95 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  27.63 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  30.13 
 
 
302 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  28.04 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00150  mitochondrial protein required for respiration, putative  26.86 
 
 
335 aa  55.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303199  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0869  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  27.83 
 
 
303 aa  55.5  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  26.72 
 
 
253 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  28.51 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  28.17 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.81 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  29.39 
 
 
348 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  26.72 
 
 
333 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04025  hypothetical protein  31.1 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  26.02 
 
 
275 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  25.74 
 
 
252 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4499  SurF1 family protein  30.33 
 
 
229 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.335507 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  23.58 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  28.93 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  29.91 
 
 
304 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  25.62 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  31.41 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  27.71 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_002978  WD1248  hypothetical protein  24.43 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.4 
 
 
256 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  21.79 
 
 
242 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  28.7 
 
 
249 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  29.52 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  27.36 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  28.25 
 
 
324 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  25.2 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  27.05 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  25.61 
 
 
254 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  25.98 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>