174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4165 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  95.38 
 
 		 238 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  80.6 
 
 		 255 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  75 
 
 		 347 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  75 
 
 		 236 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  74.55 
 
 		 243 aa  350  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  73.66 
 
 		 347 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  74.11 
 
 		 237 aa  347  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  73.66 
 
 		 237 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  73.66 
 
 		 237 aa  346  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  74.25 
 
 		 237 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  72.96 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  72.96 
 
 		 237 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  72.96 
 
 		 237 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  72.96 
 
 		 237 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  72.96 
 
 		 237 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  72.96 
 
 		 237 aa  328  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  48.71 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  48.71 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  45.54 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  43.04 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  42.79 
 
 		 251 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  40.27 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  36.18 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  38.08 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  38.08 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  35.44 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  38.92 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  37.39 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  35.34 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  38.91 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  37.44 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  38.6 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  34.06 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  36.57 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  35.48 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  40.62 
 
 		 311 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  33.33 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  28.63 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  26.19 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  29.34 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  33.04 
 
 		 254 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  32.19 
 
 		 288 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  29.54 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.67 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  27.78 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  31.56 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  30.17 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  25.33 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  24.68 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  28.39 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  30.17 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  28.21 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  29.39 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  30.17 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  30.88 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  27.12 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  30.71 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  28.74 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  27.23 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  29.79 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0026  Surfeit locus 1 family protein  29.02 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13352  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  27.17 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0610  Surfeit locus 1 family protein  25.91 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0650  Surfeit locus 1 family protein  26.2 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767888  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  25.42 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  26.92 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  29.2 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  25.64 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  26.83 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  35.51 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  28.87 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0723  Surfeit locus 1 family protein  25.21 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  26.83 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  25.85 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  33.08 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  29.02 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  28.03 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  29.61 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0474  SurF1 family protein  28.25 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.901732  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  28.7 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  25.42 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0479  SurF1 family protein  28.31 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  29.11 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2163  hypothetical protein  25.45 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04753  COX1 assembly protein Shy1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06340)  22.87 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  24 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  29.24 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  26.56 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  24.68 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  30.14 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  32.61 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  32.61 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  33.87 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  24 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>