146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13470  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11550  hypothetical protein  32.46 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.773988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  33.47 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1683  hypothetical protein  36.52 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15930  hypothetical protein  37.34 
 
 		 348 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.126803  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5350  hypothetical protein  35.14 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.905977  normal  0.275204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9301  hypothetical protein  32.7 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1413  hypothetical protein  32.66 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  34.45 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  31.72 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  33.06 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  36.18 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  32.2 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  28.81 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4439  hypothetical protein  33.58 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2325  hypothetical protein  34.51 
 
 		 305 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.57426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3348  putative transmembrane protein  32.47 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3410  putative transmembrane protein  32.47 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  0.54232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3359  putative transmembrane protein  32.47 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451355  normal  0.44953 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2714  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2566  membrane spanning protein  26.25 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0665826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0873  putative SURF1 family protein  29.5 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12264  transmembrane protein  32.28 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3278  hypothetical protein  29.51 
 
 		 345 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.00660955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3623  putative transmembrane protein  31.18 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3101  hypothetical protein  30.17 
 
 		 327 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  31.11 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06910  hypothetical protein  29.23 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0836319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2887  putative transmembrane protein  29.05 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.13886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  29.08 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  29.58 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  29.39 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  29.69 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  29.58 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  29.39 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  27.85 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  29.75 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  30.04 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  27.43 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  29.39 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  27 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5400  hypothetical protein  35.47 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  28.32 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4850  Surfeit locus 1 family protein  28.27 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  34.38 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  25.32 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1530  hypothetical protein  28.79 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0313843  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  27.57 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  28.26 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0828  hypothetical protein  29.5 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2575  hypothetical protein  32.54 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  25.34 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3549  hypothetical protein  30.47 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  27.52 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0752  hypothetical protein  28.34 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  31.23 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0012  hypothetical protein  28.22 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  29.81 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  27.64 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4333  Surfeit locus 1 family protein  26.36 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.994849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  26.72 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2034  putative SURF1 family protein  27.92 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  27.13 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.4 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0267  Surfeit locus 1 family protein  26.29 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  29.33 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4702  Surfeit locus 1 family protein  27.2 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.134361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  22.52 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2578  membrane protein  30.72 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000244629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  26.81 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0458  SurF1 family protein  25.57 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  25.81 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  26.03 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  25.51 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  28.4 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28450  hypothetical protein  27 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.555548 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0528  SurF1 family protein  25.19 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1830  Surf1 protein  26.79 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0238  Surfeit protein  25.91 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7139  Surfeit locus 1 family protein  25 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2713  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  26.24 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0479  SURF1 protein  26.79 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  25 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4774  Surfeit locus 1 family protein  29.18 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2342  Surfeit locus 1 family protein  25.88 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  25.82 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08780  hypothetical protein  27.34 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  27.56 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  26.89 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  26.75 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0675  Surfeit locus 1 family protein  26.74 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  24.07 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5104  Surfeit locus 1 family protein  27.93 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.009439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  27.87 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>