166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0267 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0320  putative transmembrane cytochrome oxidase  72.2 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0244  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  52.5 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.0169307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0369  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  53.33 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0225  putative transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor transmembrane protein  51.67 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2851  hypothetical protein  44.75 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4165  hypothetical protein  43.04 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2897  SURF1 family protein  45.21 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2757  SURF1 family protein  44.29 
 
 		 243 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0283  hypothetical protein  44.59 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0463  SURF1 family protein  44.29 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2227  Surfeit locus 1  44.75 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2840  surfeit locus 1  44.75 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.415708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6170  hypothetical protein  44.75 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0551  hypothetical protein  45.13 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0432  hypothetical protein  43.4 
 
 		 237 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0163  hypothetical protein  42.45 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1429  hypothetical protein  42.45 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0496  surf1 family protein  42.45 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2856  hypothetical protein  42.45 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0679  SURF1 family protein  42.45 
 
 		 342 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.318515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3530  putative transmembrane cytochrome oxidase  43.17 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.163991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0514  surf1 family protein  42.45 
 
 		 237 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2853  putative transmembrane cytochrome oxidase  43.17 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.283903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1251  putative transmembrane cytochrome oxidase  43.32 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.781859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0884  putative transmembrane cytochrome oxidase  42.73 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0960911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3902  hypothetical protein  44.54 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00331503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1686  hypothetical protein  39.91 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.954659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1681  putative transmembrane cytochrome oxidase  40.09 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0332  SURF1 family protein  38.3 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0106962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1934  SURF1 family protein  38.4 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3825  hypothetical protein  38.49 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.443917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0189  SURF1 family protein  33.79 
 
 		 213 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1639  SURF1 family protein  35.65 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.168422  normal  0.830928 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  45.66 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4385  putative transmembrane cytochrome oxidase  37 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3176  hypothetical protein  39.09 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.118302  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1465  Surfeit locus 1  36.92 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3005  surfeit locus 1  32.14 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.394184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0131  hypothetical protein  37.79 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0476  hypothetical protein  27.13 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0452  hypothetical protein  26.79 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2404  hypothetical protein  33.74 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3042  hypothetical protein  30.56 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0127  hypothetical protein  33.06 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1199  hypothetical protein  35.02 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.310167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0122  hypothetical protein  30.65 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  0.0246667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0124  hypothetical protein  30.58 
 
 		 253 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0298  hypothetical protein  32.08 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0107  hypothetical protein  29.6 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.481565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3488  hypothetical protein  30.94 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4071  hypothetical protein  32.63 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0120  hypothetical protein  29.05 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0663  hypothetical protein  32.57 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  hitchhiker  0.0000023563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4241  hypothetical protein  29.6 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.922626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0232  hypothetical protein  29.13 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0982408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4117  hypothetical protein  24.9 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4316  hypothetical protein  25.41 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4185  hypothetical protein  24.48 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00970  surfeit locus 1-like protein  33.2 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0074  hypothetical protein  30.98 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2907  hypothetical protein  30.92 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0150  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3452  Surfeit locus 1 family protein  30.36 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04008  transmembrane cytochrome oxidase complex biogenesis factor  29.55 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0067  hypothetical protein  30.13 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0253  hypothetical protein  28.23 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0185  hypothetical protein  34.18 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1869  hypothetical protein  27.07 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001450  cytochrome oxidase biogenesis protein Surf1 facilitates heme A insertion  28.45 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3523  hypothetical protein  36.5 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.766097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4665  hypothetical protein  30.49 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140451 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55665  mitochondrial protein involved in respiration  28.43 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.585569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3580  Surfeit locus 1 family protein  29.02 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06268  hypothetical protein  25.3 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3256  Surfeit locus 1 family protein  28.52 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21810  hypothetical protein  29.25 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0041  hypothetical protein  25.71 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0886197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1161  hypothetical protein  31.58 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.799724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2269  Surfeit locus 1 family protein  39.23 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2116  hypothetical protein  26.14 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0599  Surfeit locus 1  31.42 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2779  Surfeit locus 1 family protein  39.23 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.764047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2280  hypothetical protein  27.73 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0147  hypothetical protein  29.68 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4641  Surfeit locus 1 family protein  31.6 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136929  normal  0.114046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3924  hypothetical protein  27.87 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00286071  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0173  hypothetical protein  26.56 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3521  hypothetical protein  23.14 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3072  hypothetical protein  34.93 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0917783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0747  Surfeit locus 1  30.08 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00346081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4061  Surfeit locus 1 family protein  31.46 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914927  normal  0.293936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4611  hypothetical protein  26.16 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3786  hypothetical protein  21.58 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0148  hypothetical protein  30.47 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3869  hypothetical protein  26.34 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0193  hypothetical protein  27.98 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4003  hypothetical protein  24.05 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  30.93 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>